Pseudalkalibacillus salsuginis sp. nov., a novel salt-tolerant bacterium isolated from a saline lake sediment

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 拉伤 细菌 系统发育学 核糖体RNA 植物 嗜盐菌 微生物学 基因 遗传学 解剖
作者
Lei Gao,Bao‐Zhu Fang,Yonghong Liu,Yin Huang,Dandan Zhang,Shuang Wang,Hongchen Jiang,Wen‐Jun Li
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:72 (10)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005597
摘要

A salt-tolerant bacterium, designated strain EGI L200015T, was isolated from saline lake sediment in Xinjiang Uygur Autonomous Region, PR China. The taxonomic position of the isolate was determined using polyphasic taxonomic analysis and phylogenomic analysis. Phylogenetic analysis and 16S rRNA gene sequence similarities indicated that EGI L200015T formed a distinct clade with Pseudalkalibacillus berkeleyi KCTC 12718T with sequence identity of 98.3%. The novel isolate could be distinguished from species of the genus Pseudalkalibacillus by its distinct phenotypic, physiological and genotypic characteristics. Cells of EGI L200015T were aerobic, Gram-stain-positive, non-motile and rod-shaped. Optimal growth conditions for EGI L200015T occurred on marine agar 2216 at pH 8.0 at 30 °C. The major respiratory quinone was MK-7, while the major fatty acids (> 10 %) were anteiso-C15 : 0, iso-C15 : 0, iso-C16 : 0 and anteiso-C17 : 0. The detected polar lipids of included diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol and phosphatidylethanolamine. On the basis of the genome sequence data, the DNA G+C content of EGI L200015T was 41.6 %. On the basis of the phenotypic, physiological, genotypic and phylogenetic data, strain EGI L200015T represents a novel species of the genus Pseudalkalibacillus, for which the name Pseudalkalibacillus salsuginis sp. nov. is proposed. The type strain of the proposed novel isolate is EGI L200015T (= KCTC 43363T = CGMCC 1.19260T).
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