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Small RNA sequencing reveals dynamic microRNA expression of important nutrient metabolism during development of Camellia oleifera fruit

生物 油茶 基因 小RNA 深度测序 代谢途径 小桶 功能(生物学) 小RNA 核糖核酸 基因表达 遗传学 转录组 植物 基因组
作者
Xiaoxia Liu,Xiaofang Luo,Ke-Xin Luo,Yalin Liu,Ting Pan,Zhi-Zhang Li,Gregory J. Duns,Fu-Lin He,Zuodong Qin
出处
期刊:International Journal of Biological Sciences [Ivyspring International Publisher]
卷期号:15 (2): 416-429 被引量:23
标识
DOI:10.7150/ijbs.26884
摘要

To obtain insight into the function of miRNAs in the synthesis and storage of important nutrients during the development of Camellia oleifera fruit, Illumina sequencing of flower and fruit small-RNA was conducted. The results revealed that 797 miRNAs were significantly differentially expressed between flower and fruit samples of Camellia oleifera. Through integrated GO and KEGG function annotations, it was determined that the miRNA target genes were mainly involved in metabolic pathways, plant hormone signal transduction, fruit development, mitosis and regulation of biosynthetic processes. Carbohydrate accumulation genes were differentially regulated by miR156, miR390 and miR395 in the fruit growth and development process. MiR477 is the key miRNA functioning in regulation of genes and involved in fatty acid synthesis. Additionally, miR156 also has the function of regulating glycolysis and nutrient transformation genes.
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