Novel Prokaryotic CRISPR-Cas12a-Based Tool for Programmable Transcriptional Activation and Repression

清脆的 生物 基因组工程 Cas9 合成生物学 CRISPR干扰 基因组编辑 多粘菌拟杆菌 计算生物学 转录激活物样效应核酸酶 核酸酶 反式激活crRNA 多路复用 代谢工程 基因 遗传学 细菌
作者
Christoph Schilling,Mattheos A. G. Koffas,Volker Sieber,Jochen Schmid
出处
期刊:ACS Synthetic Biology [American Chemical Society]
卷期号:9 (12): 3353-3363 被引量:24
标识
DOI:10.1021/acssynbio.0c00424
摘要

Transcriptional perturbation using inactivated CRISPR-nucleases (dCas) is a common method in eukaryotic organisms. While rare examples of dCas9-based tools for prokaryotes have been described, multiplexing approaches are limited due to the used effector nuclease. For the first time, a dCas12a derived tool for the targeted activation and repression of genes was developed. Therefore, a previously described SoxS activator domain was linked to dCas12a to enable the programmable activation of gene expression. A proof of principle of transcriptional regulation was demonstrated on the basis of fluorescence reporter assays using the alternative host organism
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