Global view of human protein glycosylation pathways and functions

糖基化 计算生物学 糖组 生物 生物信息学 蛋白质组 蛋白质组学 糖蛋白 聚糖 生物化学 基因 生物信息学
作者
Katrine T. Schjoldager,Yoshiki Narimatsu,Hiren J. Joshi,Henrik Clausen
出处
期刊:Nature Reviews Molecular Cell Biology [Springer Nature]
卷期号:21 (12): 729-749 被引量:728
标识
DOI:10.1038/s41580-020-00294-x
摘要

Glycosylation is the most abundant and diverse form of post-translational modification of proteins that is common to all eukaryotic cells. Enzymatic glycosylation of proteins involves a complex metabolic network and different types of glycosylation pathways that orchestrate enormous amplification of the proteome in producing diversity of proteoforms and its biological functions. The tremendous structural diversity of glycans attached to proteins poses analytical challenges that limit exploration of specific functions of glycosylation. Major advances in quantitative transcriptomics, proteomics and nuclease-based gene editing are now opening new global ways to explore protein glycosylation through analysing and targeting enzymes involved in glycosylation processes. In silico models predicting cellular glycosylation capacities and glycosylation outcomes are emerging, and refined maps of the glycosylation pathways facilitate genetic approaches to address functions of the vast glycoproteome. These approaches apply commonly available cell biology tools, and we predict that use of (single-cell) transcriptomics, genetic screens, genetic engineering of cellular glycosylation capacities and custom design of glycoprotein therapeutics are advancements that will ignite wider integration of glycosylation in general cell biology.
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