Molecular Characterization and Expression Analysis of Toll-like Receptor 9 Gene in Turbot, Scophthalmus Maximus

生物 互补DNA 富含亮氨酸重复 Toll样受体9 分子生物学 基因 肽序列 先天免疫系统 外显子 信号肽 跨膜结构域 遗传学 基因组DNA cDNA末端的快速扩增
作者
Guanjie Wang,Xuepeng Li,Qiuming Liu,Xianzhi Dong,Guobin Hu
出处
期刊:Journal of clinical medicine research [Frontier Scientific Publishing Pte Ltd]
卷期号:1 (2)
标识
DOI:10.32629/jcmr.v1i2.188
摘要

Toll-like receptors (TLRs) have emerged as key sensors of invading microbes by recognizing pathogen-associated molecular patterns and activating innate immune responses. TLR9 functions as a pattern-recognition receptor that recognizes unmethylated CpG motifs in bacterial and viral DNA. In this study, the full cDNA and genomic sequences of tlr9 in Scophthalmus maximus (smtlr9) were identified and characterized. The full-length cDNA of smtlr9 was of 3754 bp encoding a polypeptide of 1066 amino acid residues. The genome sequence of smtlr9 was composed of 4083 nucleotides, including three exons and two introns. The putative Smtlr9 protein was characterized by a signal peptide sequence, a leucine-rich repeat domain (LRD) containing 15 leucine-rich repeats (LRRs), a transmembrane region, and a Toll/interleukin-1 receptor (TIR) domain. The putative protein shows the highest sequence identity (36.0~73.6%) to human and fish TLR9s. Phylogenetic analysis grouped Smtlr9 with other teleost Tlr9s. The smtlr9 mRNA was constitutively expressed in all tissues examined, with the highest level in the head kidney and kidney. The smtlr9 transcription level was up-regulated by ODN2395 in the muscle, head kidney, spleen, and gills.
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