Identification of potential key genes and immune infiltration in Multiple sclerosis

免疫系统 多发性硬化 CD8型 基因 免疫学 接收机工作特性 计算生物学 生物 发病机制 癌症研究 医学 遗传学 内科学
作者
Yang Liu,Yinglian Zhou,Hui Yue,Haitong Dou,Xinming Rang,Xin Wang,Chaohan Xu,Jin Fu
出处
期刊:Multiple sclerosis and related disorders [Elsevier BV]
卷期号:60: 103748-103748 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.msard.2022.103748
摘要

Multiple sclerosis (MS) is an extremely serious autoimmune disease of the nervous system. Extensive evidence indicated that immune system activation plays a crucial role in the development of MS. However, the exact mechanism of MS is still not well understood. Our objective was to identify potential key genes of Multiple sclerosis (MS) via bioinformatic analysis and apply CIBERSORT algorithms to calculate the proportion of infiltrating immune cells.The differentially expressed genes (DEGs) were analyzed from two public datasets, which included 99 MS, 45 controls and 133 MS, 79 controls. Then the common DEGs were obtained (p < 0.05). LASSO regression analysis was performed on common DEGs of GSE17048. The receiver operating characteristic (ROC) curves were created. The key genes were screened based on area under the receiver operating characteristic curve (AUC). CIBERSORT algorithms were used to explore the immune infiltration in MS.516 common DEGs were screened from two public datasets. And then 54 signature genes were obtained by constructing LASSO model. MS4A6A, CACNA1I, C9orf46, EIF4EBP2, SERTAD2, TGFBR2 and RAB34 with the largest AUC values were selected as the key genes. Neutrophils, Monocytes, resting memory CD4+ T cells, CD8+ T cells and resting NK cells accounted for a large proportion of infiltrating immune cells in MS.MS4A6A, CACNA1I, C9orf46, EIF4EBP2, SERTAD2, TGFBR2 and RAB34 may be closely related pathogenesis of MS, and may represent new candidate biomarkers. In addition, immune cell infiltration may also play an important role in the progression of MS.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
李东东完成签到 ,获得积分10
4秒前
王多肉完成签到,获得积分10
8秒前
Iiiilr完成签到 ,获得积分10
9秒前
杨幂完成签到,获得积分10
10秒前
17秒前
hellokitty完成签到,获得积分10
20秒前
20秒前
小四发布了新的文献求助10
21秒前
27秒前
西瓜完成签到 ,获得积分10
27秒前
包容的忆灵完成签到 ,获得积分10
30秒前
高兴尔冬发布了新的文献求助10
32秒前
xiang完成签到 ,获得积分0
35秒前
小四完成签到,获得积分10
38秒前
FashionBoy应助slayers采纳,获得30
44秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
47秒前
黑眼圈完成签到 ,获得积分10
53秒前
jia完成签到 ,获得积分10
54秒前
如履平川完成签到 ,获得积分10
55秒前
科目三应助忧伤的步美采纳,获得10
56秒前
大椒完成签到 ,获得积分10
59秒前
1分钟前
1分钟前
wisdom完成签到,获得积分10
1分钟前
slayers发布了新的文献求助30
1分钟前
1分钟前
e746700020完成签到,获得积分10
1分钟前
高兴尔冬完成签到,获得积分10
1分钟前
李爱国应助不安的秋白采纳,获得10
1分钟前
忧伤的步美完成签到,获得积分10
1分钟前
小西完成签到 ,获得积分10
1分钟前
郝老头完成签到,获得积分10
1分钟前
13313完成签到,获得积分10
1分钟前
su完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
slayers完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
知犯何逆完成签到,获得积分10
1分钟前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038039
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575756
关于积分的说明 11373782
捐赠科研通 3305574
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819239
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022