Multi-Attribute Discriminative Representation Learning for Prediction of Adverse Drug-Drug Interaction

判别式 计算机科学 机器学习 代表(政治) 人工智能 特征选择 特征学习 特征(语言学) 数据挖掘 模式识别(心理学) 政治学 语言学 政治 哲学 法学
作者
Jiajing Zhu,Yongguo Liu,Yun Zhang,Zhi Chen,Xindong Wu
出处
期刊:IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence [Institute of Electrical and Electronics Engineers]
卷期号:44 (12): 10129-10144 被引量:17
标识
DOI:10.1109/tpami.2021.3135841
摘要

Adverse drug-drug interaction (ADDI) is a significant life-threatening issue, posing a leading cause of hospitalizations and deaths in healthcare systems. This paper proposes a unified Multi-Attribute Discriminative Representation Learning (MADRL) model for ADDI prediction. Unlike the existing works that equally treat features of each attribute without discrimination and do not consider the underlying relationship among drugs, we first develop a regularized optimization problem based on CUR matrix decomposition for joint representative drug and discriminative feature selection such that the selected drugs and features can well approximate the original feature spaces and the critical factors discriminative to ADDIs can be properly explored. Different from the existing models that ignore the consistent and unique properties among attributes, a Generative Adversarial Network (GAN) framework is then designed to capture the inter-attribute shared and intra-attribute specific representations of adverse drug pairs for exploiting their consensus and complementary information in ADDI prediction. Meanwhile, MADRL is compatible with any kind of attributes and capable of exploring their respective effects on ADDI prediction. An iterative algorithm based on the alternating direction method of multipliers is developed for optimization. Experiments on publicly available dataset demonstrate the effectiveness of MADRL when compared with eleven baselines and its six variants.
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