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Molecular adaptations to psychrophily: the impact of ‘omic’ technologies

嗜冷菌 生物 基因组 蛋白质组 转录组 适应(眼睛) 计算生物学 基因组 极端环境 基因 进化生物学 分子进化 生理适应 遗传学 生态学 细菌 基因表达 神经科学
作者
Ana Casanueva,Marla Trindade,S. Craig Cary,Don A. Cowan
出处
期刊:Trends in Microbiology [Elsevier BV]
卷期号:18 (8): 374-381 被引量:242
标识
DOI:10.1016/j.tim.2010.05.002
摘要

The ability of cold-adapted microorganisms (generally referred to as psychrophiles) to survive is the result of molecular evolution and adaptations which, together, counteract the potentially deleterious effects of low kinetic energy environments and the freezing of water. These physiological adaptations are seen at many levels. Against a background of detailed comparative protein structural analyses, the recent surge of psychrophile proteome, genome, metagenome and transcriptome sequence data has triggered a series of sophisticated analyses of changes in global protein composition. These studies have revealed consistent and statistically robust changes in amino acid composition, interpreted as evolutionary mechanisms designed to destabilise protein structures, as well as identifying the presence of novel genes involved in cold adaptation. The ability of cold-adapted microorganisms (generally referred to as psychrophiles) to survive is the result of molecular evolution and adaptations which, together, counteract the potentially deleterious effects of low kinetic energy environments and the freezing of water. These physiological adaptations are seen at many levels. Against a background of detailed comparative protein structural analyses, the recent surge of psychrophile proteome, genome, metagenome and transcriptome sequence data has triggered a series of sophisticated analyses of changes in global protein composition. These studies have revealed consistent and statistically robust changes in amino acid composition, interpreted as evolutionary mechanisms designed to destabilise protein structures, as well as identifying the presence of novel genes involved in cold adaptation.
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