CRISPR/Cas9 Plasmid Delivery Through the CPP: PepFect14

清脆的 基因组编辑 Cas9 质粒 转录激活物样效应核酸酶 锌指核酸酶 生物 基因靶向 基因 计算生物学 遗传学 细胞生物学
作者
Luca Falato,Birgit Vunk,Ülo Langel
出处
期刊:Methods in molecular biology [Springer Science+Business Media]
卷期号:: 587-593 被引量:5
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-1752-6_38
摘要

Gene editing is increasing its popularity day by day especially as an essential tool for the research. It is based on two recombination mechanisms in mammalian cells: nonhomologous end-joining (NHEJ) and homology-directed repair (HDR). The first one can be used to silence a specific gene or a portion of it and the second one to insert new DNA, in presence of a donor template, in a targeted position in the genome. In order to exploit one of these two mechanisms, three major targeted nucleases have been developed: zinc-finger nucleases (ZFN), transcription activator-like effector nucleases (TALEN), and CRISPR-Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-associated protein). The last one seems to be the most promising tool among the others for gene editing. By using the properties and versatility of the Cell Penetrating Peptide (CPP) PepFect14, we developed a protocol to deliver a plasmid encoding for CRISPR-Cas9 and Green Fluorescent Protein (GFP) in BHM cell line expressing luciferase (Bomirsky Hamster Melanoma pLuc). Aiming to knocking down the luciferase gene in the cell line and to expressing GFP. Having two fast and easy read-outs of the plasmid's activity at the same time. Furthermore, by labeling the CRISPR plasmid with Cy5 it is possible to have a visual confirmation of the cellular uptake of the pDNA/CPP complex, via fluorescent microscopy, as described.

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