已入深夜,您辛苦了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!祝你早点完成任务,早点休息,好梦!

Mechanistic Exploration of Methionine 274 Acting as a “Switch” of the Selective Pocket Involved in HDAC8 Inhibition: An in Silico Study

生物信息学 化学 对接(动物) 分子动力学 立体化学 生物化学 计算生物学 HDAC8型 生物 组蛋白脱乙酰基酶 组蛋白 医学 DNA 计算化学 基因 护理部
作者
Yao Peng,Qiushuang Gao,Ying Wang,Qizheng Yao,Ji Zhang
出处
期刊:ChemMedChem [Wiley]
卷期号:16 (12): 1933-1944 被引量:3
标识
DOI:10.1002/cmdc.202001004
摘要

Abstract The overexpression of histone deacetylase 8 (HDAC8) causes several diseases, and the selective inhibition of HDAC8 has been touted as a promising therapeutic strategy due to its fewer side effects. However, the mechanism of HDAC8 selective inhibition remains unclear. In this study, flexible docking and in silico mutation were used to explore the structural change of methionine (M274) during HDAC8 binding to inhibitors, along with the reason for this change. Meanwhile, steered and conventional molecular dynamics simulations were employed to explore the stability of the structural change. The findings suggest that M274 acts as a “switch” to control the exposure of the HDAC8‐selective pocket. The structure of M274 changes from flipped‐out to flipped‐in only when L‐shaped inhibitors bind to HDAC8. This structural change forms a groove that allows these inhibitors to enter the selective pocket. In other HDACs, a leucine residue replaces M274 in situ, and the same structural change is not observed. The findings reveal the mechanism of selective HDAC8 inhibition and provide guidance for the development of novel selective inhibitors.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
辛勤的乌发布了新的文献求助10
1秒前
1秒前
Liu完成签到,获得积分10
2秒前
圆圆完成签到 ,获得积分10
3秒前
小方发布了新的文献求助10
3秒前
3秒前
5秒前
学术渣发布了新的文献求助10
7秒前
9秒前
子阅完成签到 ,获得积分10
9秒前
共享精神应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
小蘑菇应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
在水一方应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
Lucas应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
爆米花应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
Ava应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
上官若男应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
慕青应助科研通管家采纳,获得10
11秒前
11秒前
情怀应助科研通管家采纳,获得10
11秒前
11秒前
11秒前
热心市民小红花应助fishfun采纳,获得10
11秒前
Ultraman45发布了新的文献求助10
11秒前
13秒前
Jasper应助叶强采纳,获得10
14秒前
慕青应助光而不耀采纳,获得10
15秒前
二一完成签到 ,获得积分10
15秒前
英俊的铭应助小方采纳,获得10
15秒前
16秒前
16秒前
庄冬丽发布了新的文献求助10
17秒前
17秒前
19秒前
小蘑菇应助Ultraman45采纳,获得10
20秒前
xiaoxu发布了新的文献求助10
21秒前
22秒前
23秒前
天天快乐应助文静的海采纳,获得10
23秒前
混子发布了新的文献求助10
23秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3976455
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3520548
关于积分的说明 11203728
捐赠科研通 3257156
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798618
邀请新用户注册赠送积分活动 877819
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806523