Biogenesis and regulatory hierarchy of phased small interfering RNAs in plants

小干扰RNA 反式siRNA 生物 小RNA 基因沉默 生物发生 小RNA RNA沉默 计算生物学 核糖核酸 RNA干扰 细胞生物学 阿尔戈瑙特 长非编码RNA 遗传学 基因
作者
Pingchuan Deng,Muhammad Sajid,Min Cao,Liang Wu
出处
期刊:Plant Biotechnology Journal [Wiley]
卷期号:16 (5): 965-975 被引量:65
标识
DOI:10.1111/pbi.12882
摘要

Summary Several varieties of small RNAs including microRNAs (miRNAs) and small interfering RNAs (siRNAs) are generated in plants to regulate development, genome stability and response to adverse environments. Phased siRNA (phasiRNA) is a type of secondary siRNA that is processed from a miRNA‐mediated cleavage of RNA transcripts, increasing silencing efficiency or simultaneously suppressing multiple target genes. Trans ‐acting siRNAs (ta‐siRNAs) are a particular class of phasiRNA produced from noncoding transcripts that silence targets in trans . It was originally thought that ‘one‐hit’ and ‘two‐hit’ models were essential for processing distinct TAS precursors; however, a single hit event was recently shown to be sufficient at triggering all types of ta‐siRNAs. This review discusses the findings about biogenesis, targeting modes and regulatory networks of plant ta‐siRNAs. We also summarize recent advances in the generation of other phasiRNAs and their possible biological benefits to plants.
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