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From Experiments to a Fast Easy-to-Use Computational Methodology to Predict Human Aldehyde Oxidase Selectivity and Metabolic Reactions

醛氧化酶 化学 异型生物质的 生化工程 人类健康 计算生物学 生物化学 生物 医学 环境卫生 工程类 催化作用 黄嘌呤氧化酶
作者
Gabriele Cruciani,Nicolò Milani,Paolo Benedetti,Susan Lepri,Lucia Cesarini,Massimo Baroni,Francesca Spyrakis,Sara Tortorella,Edoardo Mosconi,Laura Goracci
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:61 (1): 360-371 被引量:30
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.7b01552
摘要

Aldehyde oxidase (AOX) is a molibdo-flavoenzyme that has raised great interest in recent years, since its contribution in xenobiotic metabolism has not always been identified before clinical trials, with consequent negative effects on the fate of new potential drugs. The fundamental role of AOX in metabolizing xenobiotics is also due to the attempt of medicinal chemists to stabilize candidates toward cytochrome P450 activity, which increases the risk for new compounds to be susceptible to AOX nucleophile attack. Therefore, novel strategies to predict the potential liability of new entities toward the AOX enzyme are urgently needed to increase effectiveness, reduce costs, and prioritize experimental studies. In the present work, we present the most up-to-date computational method to predict liability toward human AOX (hAOX), for applications in drug design and pharmacokinetic optimization. The method was developed using a large data set of homogeneous experimental data, which is also disclosed as Supporting Information .
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