Mutation analysis of TMEM family members for early-onset Parkinson’s disease in Chinese population

遗传学 生物 突变 中国人口 疾病 中国家庭 帕金森病 基因 医学 内科学 基因型
作者
Chunyu Li,Ruwei Ou,Yongping Chen,Xiaojing Gu,Qianqian Wei,Bei Cao,Lingyu Zhang,Yanbing Hou,Kuncheng Liu,Xueping Chen,Wei Song,Bi Zhao,Ying Wu,Yi Liu,Huifang Shang
出处
期刊:Neurobiology of Aging [Elsevier]
卷期号:101: 299.e1-299.e6 被引量:19
标识
DOI:10.1016/j.neurobiolaging.2020.11.005
摘要

Members of the transmembrane (TMEM) protein family have been identified to be associated with Parkinson’s disease (PD) and other neurodegenerative disorders. However, most studies were based on the European-ancestry population and were still awaiting replications. Here, we aimed to systematically evaluate the associations of TMEMs with PD in a large Chinese early-onset PD (EOPD, age at onset <50 years) cohort. We identified rare variants (minor allele frequency <0.01) in 743 unrelated EOPD patients using whole-exome sequencing and evaluated the association between variants and EOPD at allele and gene levels. Totally 45 rare variants were identified in 6 TMEM protein family members. At allele level, p.176 K>E in TMEM175 and p.33P>R in TMEM163 were significantly associated with PD. Gene-based burden analysis showed a clear enrichment of TMEM163 variants in EOPD. Our work identifies 2 novel rare variants and TMEM163 as potential risk factors for PD provide a better understanding of the genetic involvement of TMEM protein family members in EOPD and broadens the current mutation spectrum of PD.
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