Application of different approaches to generate virtual patient populations for the quantitative systems pharmacology model of erythropoiesis

红细胞生成 计算机科学 临床药理学 药理学 计算生物学 医学 生物 内科学 贫血
作者
Galina Kolesova,Alexander A. Stepanov,Галина Лебедева,Oleg Demin
出处
期刊:Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics [Springer Nature]
卷期号:49 (5): 511-524 被引量:6
标识
DOI:10.1007/s10928-022-09814-y
摘要

In a standard situation, a quantitative systems pharmacology model describes a "reference patient," and the model parameters are fixed values allowing only the mean values to be described. However, the results of clinical trials include a description of variability in patients' responses to a drug, which is typically expressed in terms of conventional statistical parameters, such as standard deviations (SDs) from mean values. Therefore, in this study, we propose and compare four different approaches: (1) Monte Carlo Markov Chain (MCMC); (2) model fitting to Monte Carlo sample; (3) population of clones; (4) stochastically bounded selection to generate virtual patient populations based on experimentally measured mean data and SDs. We applied these approaches to generate virtual patient populations in the QSP model of erythropoiesis. According to the results of our research, stochastically bounded selection showed slightly better results than the other three methods as it allowed the description of any number of patients from clinical trials and could be applied in the case of complex models with a large number of variable parameters.
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