Neutralizing monoclonal antibodies elicited by mosaic RBD nanoparticles bind conserved sarbecovirus epitopes

表位 单克隆抗体 抗体 病毒学 三聚体 中和 化学 分子生物学 生物 病毒 遗传学 有机化学 二聚体
作者
C. Fan,Alexander A Cohen,Miso Park,Alfur Fu-Hsin Hung,Jennifer R Keeffe,Priyanthi NP Gnanapragasam,Yu E Lee,Leesa M Kakutani,Ziyan Wu,Kathryn E Malecek,John C Williams,Pamela J. Bjorkman
标识
DOI:10.1101/2022.06.28.497989
摘要

Protection from SARS-related coronaviruses with spillover potential and SARS-CoV-2 variants could prevent and/or end pandemics. We show that mice immunized with nanoparticles co-displaying spike receptor-binding domains (RBDs) from eight sarbecoviruses (mosaic-8 RBD-nanoparticles) efficiently elicit cross-reactive anti-sarbecovirus antibodies against conserved class 1/4 and class 3 RBD epitopes. Monoclonal antibodies (mAbs) identified from initial screening of <10,000 single B-cells secreting IgGs binding two or more sarbecovirus RBDs showed cross-reactive binding and neutralization of SARS-CoV-2 variants and animal sarbecoviruses. Single-particle cryo-EM structures of antibody-spike complexes, including a Fab-Omicron complex, mapped neutralizing mAbs to conserved class 1/4 RBD epitopes and revealed neutralization mechanisms, potentials for intra-spike trimer crosslinking by single IgGs, and induced changes in trimer upon Fab binding. In addition, we identified a mAb resembling Bebtelovimab, an EUA-approved human class 3 anti-RBD mAb. These results support using mosaic RBD-nanoparticles to identify therapeutic pan-sarbecovirus and pan-variant mAbs and to elicit them by vaccination.
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