Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of AfeH from Acimetobacter sp. DL-2

结晶 结晶学 晶体结构 单体 水解酶 化学 溶剂 丙酸盐 X射线 聚合物 有机化学 物理 量子力学
作者
Huiling Tang,Xiaoran Zhang,Y. Y. Duan,Yan Huang
出处
期刊:Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications [Wiley]
卷期号:81 (1)
标识
DOI:10.1107/s2053230x24012275
摘要

Fenoxaprop-P-ethyl (FE) is widely applied as a post-emergence aryloxyphenoxy propionate (AOPP) herbicide in agriculture. A novel FE hydrolase esterase from Acinetobacter sp. DL-2 (AfeH) was identified which belongs to the family IV carboxylesterases and shows less than 30% identity to other reported homologues with known structure. In order to understand the catalytic mechanism, recombinant AfeH was prepared in Escherichia coli and crystallized using the sitting-drop vapor-diffusion method. X-ray diffraction data were collected to 1.9 Å resolution. The crystal belonged to space group P 12 1 1, with unit-cell parameters a = 84.27, b = 46.74, c = 258.68 Å. The Matthews coefficient ( V M ) was calculated to be 2.43 Å 3 Da −1 , which corresponds to a solvent content of 49.4%, suggesting the presence of three monomers in the crystallographic asymmetric unit. The crystal was assessed to be suitable for further structural determination, which is currently in progress.

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