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Shiella aurantiaca gen. nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from activated sludge, and proposal of Shiellaceae fam. nov.

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 细菌 系统发育学 拉伤 植物 谱系(遗传) 核糖体RNA 基因 遗传学 解剖
作者
Bin Liu,Yingying Wan,Le Liu,Yu Liu,Qi Zhang,Dan Cheng,Jian He,Qirong Shen
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (11)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006175
摘要

A novel Gram-stain-negative, long rod-shaped, aerobic, non-motile, non-spore-forming and orange-pigmented bacterium, designated LB-30 T , was isolated from activated sludge. Growth was observed at 15–40 °C (optimum 30 °C), pH 6.0–9.0 (optimum 7.0) and salinities of 0–3.0 % (w/v; optimum 2.0 %). LB-30 T showed less than 89.9 % sequence similarities to the recognized taxa of the order Cytophagales . The results of phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences and phylogenomic tree indicated that LB-30 T formed a distinct lineage within the order Cytophagales . The average amino acid identity (AAI) values between LB-30 T and members of the related families Cyclobacteriaceae , Fulvivirgaceae , Roseivirgaceae , Reichenbachiellaceae , Cesiribacteraceae , Cytophagaceae and Hymenobacteraceae in the order Cytophagales were 50.5–54.6 %. The sole respiratory quinone of LB-31 T was menaquinone 7 (MK-7). The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, aminolipid and four unidentified lipids. The major fatty acids were iso-C 15 : 0 , iso-C 15 : 1 G and iso-C 17 : 0 3-OH. The DNA G+C content was 43.8 mol%, calculated from the genome sequence. On the basis of differences in the phenotypic, physiological and biochemical characteristics, and distinct phylogenetic relationships, strain LB-30 T is proposed to represent a novel species in a novel genus for which the name Shiella aurantiaca gen. nov., sp. nov is proposed, within a novel family Shiellaceae fam. nov. of the order Cytophagales . The type strain is LB-30 T (=GDMCC 1.3629 T = KCTC 92689 T ).
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