Functional Characterization of the S. cerevisiae Genome by Gene Deletion and Parallel Analysis

开放式参考框架 基因组 生物 打开阅读框 遗传学 酿酒酵母 基因 全基因组测序 表型 功能(生物学) 基因组大小 计算生物学 肽序列
作者
Elizabeth A. Winzeler,Daniel Shoemaker,Anna Astromoff,Hong Liang,Keith M. Anderson,Brunó André,Rhonda Bangham,Rocí­o Benito,Jef D. Boeke,Howard Bussey,Angela M. Chu,Carla Connelly,Karen Davis,Fred S. Dietrich,Sally Dow,Mohamed El Bakkoury,Françoise Foury,Stephen H. Friend,Erik Gentalen,Guri Giaever,Johannes H. Hegemann,Ted Jones,Michael T. Laub,Hong Liao,Nicole Liebundguth,David J. Lockhart,Anca Lucau-Danila,Marc Lussier,Nasiha M’Rabet,Patrice Ménard,Michael Mittmann,Chai Pai,Corinne Rebischung,José Luis Revuelta,Linda Riles,Christopher J. Roberts,Petra Ross‐Macdonald,Bart Scherens,M Snyder,Sharon Sookhai-Mahadeo,Reginald Storms,Steeve Véronneau,Marleen Voet,Guido Volckaert,Teresa R. Ward,Robert Wysocki,Grace Yen,Kexin Yu,Katja Zimmermann,Peter Philippsen,Mark Johnston,Ronald W. Davis
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:285 (5429): 901-906 被引量:3770
标识
DOI:10.1126/science.285.5429.901
摘要

The functions of many open reading frames (ORFs) identified in genome-sequencing projects are unknown. New, whole-genome approaches are required to systematically determine their function. A total of 6925 Saccharomyces cerevisiae strains were constructed, by a high-throughput strategy, each with a precise deletion of one of 2026 ORFs (more than one-third of the ORFs in the genome). Of the deleted ORFs, 17 percent were essential for viability in rich medium. The phenotypes of more than 500 deletion strains were assayed in parallel. Of the deletion strains, 40 percent showed quantitative growth defects in either rich or minimal medium.
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