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Design and Engineering of Light‐Induced Base Editors Facilitating Genome Editing with Enhanced Fidelity

基因组编辑 光遗传学 计算生物学 碱基对 基因组工程 DNA 基因组 核苷酸 基础(拓扑) 基因 生物 纳米技术 计算机科学 遗传学 化学 材料科学 数学分析 数学 神经科学
作者
Yangning Sun,Qi Chen,Yanbing Cheng,Xi Wang,Zixin Deng,Fuling Zhou,Yuhui Sun
出处
期刊:Advanced Science [Wiley]
卷期号:11 (5) 被引量:2
标识
DOI:10.1002/advs.202305311
摘要

Abstract Base editors, which enable targeted locus nucleotide conversion in genomic DNA without double‐stranded breaks, have been engineered as powerful tools for biotechnological and clinical applications. However, the application of base editors is limited by their off‐target effects. Continuously expressed deaminases used for gene editing may lead to unwanted base alterations at unpredictable genomic locations. In the present study, blue‐light‐activated base editors (BLBEs) are engineered based on the distinct photoswitches magnets that can switch from a monomer to dimerization state in response to blue light. By fusing the N‐ and C‐termini of split DNA deaminases with photoswitches Magnets, efficient A‐to‐G and C‐to‐T base editing is achieved in response to blue light in prokaryotic and eukaryotic cells. Furthermore, the results showed that BLBEs can realize precise blue light‐induced gene editing across broad genomic loci with low off‐target activity at the DNA‐ and RNA‐level. Collectively, these findings suggest that the optogenetic utilization of base editing and optical base editors may provide powerful tools to promote the development of optogenetic genome engineering.
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