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Learning a reactive potential for silica-water through uncertainty attribution

硅酸盐 反应性(心理学) 稳健性(进化) 分子动力学 纳米孔 水溶液 化学物理 催化作用 相(物质) 材料科学 化学 化学工程 计算化学 纳米技术 物理化学 有机化学 病理 工程类 基因 医学 替代医学 生物化学
作者
Swagata Roy,Johannes P. Dürholt,Thomas S. Asche,Federico Zipoli,Rafael Gómez‐Bombarelli
出处
期刊:Cornell University - arXiv 被引量:4
标识
DOI:10.48550/arxiv.2307.01705
摘要

The reactivity of silicates in an aqueous solution is relevant to various chemistries ranging from silicate minerals in geology, to the C-S-H phase in cement, nanoporous zeolite catalysts, or highly porous precipitated silica. While simulations of chemical reactions can provide insight at the molecular level, balancing accuracy and scale in reactive simulations in the condensed phase is a challenge. Here, we demonstrate how a machine-learning reactive interatomic potential can accurately capture silicate-water reactivity. The model was trained on a new dataset comprising 400,000 energies and forces of molecular clusters at the $\omega$-B97XD def2-TVZP level. To ensure the robustness of the model, we introduce a new and general active learning strategy based on the attribution of the model uncertainty, that automatically isolates uncertain regions of bulk simulations to be calculated as small-sized clusters. Our trained potential is found to reproduce static and dynamic properties of liquid water and solid crystalline silicates, despite having been trained exclusively on cluster data. Furthermore, we utilize enhanced sampling simulations to recover the self-ionization reactivity of water accurately, and the acidity of silicate oligomers, and lastly study the silicate dimerization reaction in a water solution at neutral conditions and find that the reaction occurs through a flanking mechanism.

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