Pan-cancer analysis of COL15A1: an immunological and prognostic biomarker

免疫系统 微卫星不稳定性 生物 恶性肿瘤 癌症 肿瘤进展 生物标志物 癌症研究 SNP公司 单核苷酸多态性 免疫学 基因型 遗传学 基因 微卫星 等位基因
作者
Бо Лю,Qianheng Jiang,Jun Meng,Haichun Zhao,Jie Lin
出处
期刊:Discover Oncology [Springer Nature]
卷期号:15 (1) 被引量:1
标识
DOI:10.1007/s12672-024-01200-z
摘要

Abstract Collagen, type XV, alpha 1 (COL15A1) belongs to the collagen superfamily, which can influence disease progression by modulating immune pathways. Although the growing number of investigations demonstrating the indispensable role of COL15A1 in the progression of certain tumors, no pan-cancer assessment of COL15A1 is accessible to date. Therefore, the available data was used to explore the role of COL15A1 in 33 types of tumors and to investigate their potential immune function. Numerous bioinformatics approaches were used to research the potential oncogenic role of COL15A1, including analysis of tumor prognosis, microsatellite instability (MSI), tumor mutational burden (TMB), single nucleotide polymorphism (SNP), drug sensitivity, immune cell infiltration, and the correlation between cancer stem cells (CSCs) and COL15A1 expression. The outcome implies that most tumors had a high expression of COL15A1, and COL15A1 manifested different relationships with prognosis in different tumors, including both positive and negative correlations. COL15A1 was also found to have a significant correlation with MSI, TMB, and immune infiltrating cells. Our study suggests that COL15A1 may serve as a prognostic marker for malignancy because of its differential expression in tissues and their function in tumor immunity.
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