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Transcriptome-Connectome association from fetal stage to adulthood

转录组 连接体 联想(心理学) 阶段(地层学) 胎儿 计算机科学 计算生物学 生物 神经科学 怀孕 心理学 遗传学 基因 基因表达 古生物学 功能连接 心理治疗师
作者
Minhui Ouyang,Tanay Poddar,Gabriel Santpere,David Andrijević,Shaojie Ma,Kartik Pattabiraman,Kevin T. Gobeske,Nenad Šestan,Hao Huang
标识
DOI:10.58530/2024/2389
摘要

Motivation: Transcriptome, representing the set of gene expression, exhibits spatiotemporal heterogeneity during brain development, underlying the dramatic changes in brain structural connectivity as measured by diffusion MRI throughout development. Goal(s): Our goal was to elucidate the association between macroscopic structural connectome and microscopic transcriptome across development. Approach: Here, we revealed this dynamic association between structural connectome and gene expression from a large cohort of 336 participants from fetal stage to adulthood. Results: The changes of associated genes’ enrichment in cell types, biological processes, cellular components, and molecular functions across different ages shed light into the dynamic transcriptomic roles in connectome maturation. Impact: By associating transcriptome map from over 6500 protein-encoding genes and dMRI-derived structural network, we revealed spatiotemporally heterogeneous transcriptome-connectome association from fetal stage to adulthood, providing insights into genetically patterned process of brain topological changes in health and disease.

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