Multi-omics analyses and botanical perfumer hypothesis provide insights into the formation and maintenance of aromatic characteristics of Dendrobium loddigesii flowers

生物 植物
作者
Zhihui Du,Yuxuan Jin,Xiyu Yang,Kuaifei Xia,Zhilin Chen
出处
期刊:Plant Physiology and Biochemistry [Elsevier BV]
卷期号:214: 108891-108891 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108891
摘要

Dendrobium loddigesii, a member of the Orchidaceae family, is a valuable horticultural crop known for its aromatic qualities. However, the mechanisms responsible for the development of its aromatic characteristics remain poorly understood. To elucidate these underlying mechanisms, we assembled the first chromosome-level reference genome of D. loddigesii using PacBio HiFi-reads, Illumina short-reads, and Hi-C data. The assembly comprises 19 pseudochromosomes with N50 contig and N50 scaffold sizes of 55.15 and 89.94 Mb, respectively, estimating the genome size to be 1.68 Gb, larger than that of other sequenced Dendrobium species. During the flowering stages, we conducted a comprehensive analysis combining volatilomics and transcriptomics to understand the characteristics and biosynthetic mechanisms pathways of the floral scent. Our findings emphasize the significant contribution of aromatic terpenoids, especially monoterpenoids, in defining the floral aroma. Furthermore, we identified two crucial terpene synthase (TPS) genes that play a key role in maintaining the aroma during flowering. Through the integration volatilomics data with catalytic assays of DlTPSbs proteins, we identified specific compounds responsible for the aromatic characteristics of D. loddigesii. This integrated analysis of the genome, transcriptome, and volatilome, offers valuable insights into the development and preservation of D. loddigesii's aromatic characteristics, setting the stage for further exploration of the botanical perfumer hypothesis.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
虚心蜗牛完成签到 ,获得积分10
1秒前
3秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
3秒前
nightmare完成签到,获得积分20
4秒前
哭泣笑柳发布了新的文献求助10
5秒前
nightmare发布了新的文献求助10
7秒前
大橙子发布了新的文献求助10
10秒前
12秒前
Zhh完成签到 ,获得积分10
12秒前
Tina完成签到,获得积分10
14秒前
微生完成签到 ,获得积分10
14秒前
15秒前
chhzz完成签到 ,获得积分10
16秒前
飞舞伤寒发布了新的文献求助20
16秒前
曾珍发布了新的文献求助10
18秒前
qwe完成签到,获得积分10
19秒前
Xdz完成签到 ,获得积分10
19秒前
cai完成签到 ,获得积分10
22秒前
雨恋凡尘完成签到,获得积分0
25秒前
羊羔肉完成签到,获得积分10
27秒前
胖丁完成签到,获得积分10
27秒前
笨笨凡松完成签到,获得积分10
30秒前
飞舞伤寒完成签到,获得积分10
30秒前
贝利亚完成签到,获得积分10
32秒前
喜多多的小眼静完成签到 ,获得积分10
32秒前
32秒前
Dsunflower完成签到 ,获得积分10
33秒前
羊羔肉发布了新的文献求助50
34秒前
半夏发布了新的文献求助10
34秒前
35秒前
35秒前
大橙子发布了新的文献求助10
36秒前
星辰大海应助贝利亚采纳,获得10
36秒前
37秒前
sunny心晴完成签到 ,获得积分10
39秒前
独特的凝云完成签到 ,获得积分10
39秒前
TheDing完成签到,获得积分10
40秒前
传奇3应助lenetivy采纳,获得10
42秒前
积极的忆曼完成签到,获得积分10
43秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
43秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038201
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575940
关于积分的说明 11373987
捐赠科研通 3305747
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819274
邀请新用户注册赠送积分活动 892662
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022