亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Detecting circular RNAs: bioinformatic and experimental challenges

计算生物学 生物 环状RNA 核糖核酸 基因组 遗传学 基因
作者
Linda Szabo,Julia Salzman
出处
期刊:Nature Reviews Genetics [Springer Nature]
卷期号:17 (11): 679-692 被引量:592
标识
DOI:10.1038/nrg.2016.114
摘要

Circular RNAs (circRNAs) are pervasively expressed in eukaryotic genomes, representing the major transcript isoform for many genes. In this article, the authors review sources of experimental and bioinformatic biases that complicate the accurate discovery of circRNAs and discuss statistical approaches used by published algorithms to address these biases. The pervasive expression of circular RNAs (circRNAs) is a recently discovered feature of gene expression in highly diverged eukaryotes. Numerous algorithms that are used to detect genome-wide circRNA expression from RNA sequencing (RNA-seq) data have been developed in the past few years, but there is little overlap in their predictions and no clear gold-standard method to assess the accuracy of these algorithms. We review sources of experimental and bioinformatic biases that complicate the accurate discovery of circRNAs and discuss statistical approaches to address these biases. We conclude with a discussion of the current experimental progress on the topic.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
我就是来找文献的完成签到,获得积分10
2秒前
李健应助坚定岂愈采纳,获得10
10秒前
11秒前
zzyh307完成签到 ,获得积分0
16秒前
锋芒不毕露完成签到,获得积分10
20秒前
20秒前
DIDIDI完成签到 ,获得积分10
23秒前
24秒前
24秒前
36秒前
39秒前
42秒前
战红缨发布了新的文献求助10
42秒前
43秒前
53秒前
59秒前
赘婿应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
彭于晏应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
缓慢的翅膀完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
雪中发布了新的文献求助10
1分钟前
海豚完成签到 ,获得积分10
1分钟前
always完成签到 ,获得积分10
1分钟前
我心飞扬完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
璐璐完成签到 ,获得积分10
1分钟前
王先生完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
远方发布了新的文献求助10
1分钟前
2分钟前
shi完成签到,获得积分20
2分钟前
把的蛮耐得烦完成签到,获得积分10
2分钟前
心杨完成签到 ,获得积分10
2分钟前
shi发布了新的文献求助10
2分钟前
多摩川的烟花少年完成签到,获得积分10
2分钟前
MMMMMeng完成签到,获得积分10
2分钟前
2分钟前
2分钟前
在水一方应助coco采纳,获得10
2分钟前
高分求助中
Evolution 10000
Sustainability in Tides Chemistry 2800
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
Diagnostic immunohistochemistry : theranostic and genomic applications 6th Edition 500
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
China's Relations With Japan 1945-83: The Role of Liao Chengzhi 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3150492
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2801881
关于积分的说明 7845881
捐赠科研通 2459245
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1309130
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 628656
版权声明 601727