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Tumor-associated microbiota in colorectal cancer with vascular tumor thrombus and neural invasion and association with clinical prognosis

结直肠癌 肠道菌群 癌症 生物标志物 内科学 医学 队列 血栓 扩增子测序 微生物群 生物 肿瘤科 病理 16S核糖体RNA 生物信息学 细菌 免疫学 遗传学
作者
Mingjie Li,Min Jin,Lei Zhao,Dandan Yu,Yan Li,Linli Shi,Bin Zhou,Li Liu,Yinghao Cao,Kailin Cai,Jun Fan,Xiu Nie,Tao Zhang,Hongli Liu
出处
期刊:Acta Biochimica et Biophysica Sinica [Oxford University Press]
被引量:1
标识
DOI:10.3724/abbs.2023255
摘要

Neural invasion (NI) and vascular tumor thrombus (VT) are associated with poor prognosis in patients with colorectal cancer (CRC). In this study, we apply 16S rRNA amplicon sequencing to tumor tissues and adjacent normal tissues in patients with CRC to determine the microbial differences. A discovery cohort, including 30 patients with NI, 23 with VT, and 35 with double-negative CRC tissue, is utilized. Then, we analyze the relationship between the specific bacterial taxa and indicators of different dimensions in separate cohorts. In the discovery cohort, the diversity and composition of the gut microbiome distinctly differ between the tumor and nontumor tissues in the NI and VT groups. A high abundance of
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