The myosin family genes in soybean: Genome-wide identification and expression analysis

肌球蛋白 生物 基因 基因家族 基因复制 基因组 大豆 遗传学 基因表达 计算生物学 甘氨酸 细胞生物学 氨基酸
作者
Xiangbo Duan,Ke Zhang,Huizi Duanmu,Youjian Yu
出处
期刊:South African Journal of Botany [Elsevier]
卷期号:160: 338-346 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.sajb.2023.06.054
摘要

Myosin proteins are molecular motors that play key roles in numerous cellular processes. However, little is known about this family in legume, especially in the important crop plant soybean (Glycine max). Here we performed systematic analyses of the myosin gene family in soybean. In the soybean genome, 26 myosin genes were identified, and were grouped into two major classes: class VIII and class XI. The two myosin classes differ in composition of conserved domains and gene structure. All the myosin genes were found involved in gene duplication events and a total of 27 duplication pairs were detected. Promoter analysis and GO enrichment imply the multiple potential functions of soybean myosins. Based on RNA-seq data, their expression profiles in different tissues/organs and in response to abiotic stresses were investigated. The results suggested that they participate in various biological processes during plant growth and development. Overall, our study promotes further understanding of plant myosins, as well as provides valuable clues for functional studies on this gene family.
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