circRNA-disease association prediction with an improved unbalanced Bi-Random walk

随机游动 计算机科学 医学 统计 数学
作者
Ahmet Toprak
出处
期刊:Journal of Radiation Research and Applied Sciences [Elsevier BV]
卷期号:17 (2): 100858-100858
标识
DOI:10.1016/j.jrras.2024.100858
摘要

Studies show that circular RNAs (circRNAs), a type of non-coding RNAs, play various roles in biological processes such as the formation and progression of many different diseases. For this reason, identifying potential circRNAs associated with diseases is vital for early diagnosis. Determining these relationships experimentally requires a long process and is also expensive. For this reason, computational models are being developed to determine the relationships between circRNA and diseases. In this study, we recommend a technique called Improved Unbalanced Bi-Random Walk (UBRW) to identify potential circRNAs associated with diseases. The commonly used 5-fold cross-validation (CV) technique and leave one-out cross-validation (LOOCV) technique were applied to verify the predictive ability of our technique. The area under curve (AUC) values calculated in 5-fold CV and LOOCV are 0.8910 and 0.9669, respectively. Case studies on the commonly occurring gastric cancer and breast cancer were conducted to further validate the predictive performance of our method. When the results were examined, it was seen that the prediction ability of the UBRW method was quite successful.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
量子星尘发布了新的文献求助10
2秒前
Blaseaka完成签到 ,获得积分10
3秒前
Owen应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
深情安青应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
3秒前
汉堡包应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
小二郎应助科研通管家采纳,获得30
4秒前
爆米花应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
沉静的浩然完成签到,获得积分10
5秒前
开朗的绮山完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
老迟到的土豆完成签到 ,获得积分10
8秒前
单薄的日记本完成签到,获得积分10
8秒前
大橙子发布了新的文献求助10
9秒前
舒适的天奇完成签到 ,获得积分10
10秒前
11秒前
13秒前
都是小儿卡通书完成签到,获得积分10
14秒前
15秒前
陶醉的又夏完成签到 ,获得积分10
15秒前
lily完成签到 ,获得积分10
18秒前
19秒前
子苓完成签到 ,获得积分10
21秒前
Jun完成签到 ,获得积分10
21秒前
phil完成签到,获得积分10
22秒前
祁乐安发布了新的文献求助20
22秒前
如初完成签到,获得积分10
23秒前
zzuwxj完成签到,获得积分10
26秒前
糊涂的语兰完成签到,获得积分10
30秒前
多余完成签到,获得积分10
31秒前
喝酸奶不舔盖完成签到 ,获得积分10
31秒前
朴实初夏完成签到 ,获得积分10
32秒前
32秒前
华仔应助查查make采纳,获得10
37秒前
乐乐应助普鲁卡因采纳,获得10
37秒前
美海与鱼完成签到,获得积分10
37秒前
哦豁完成签到 ,获得积分10
38秒前
阿钱小钱完成签到 ,获得积分10
39秒前
世上僅有的榮光之路完成签到,获得积分0
39秒前
能干的蜗牛完成签到,获得积分10
40秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038157
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575869
关于积分的说明 11373842
捐赠科研通 3305650
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819255
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022