MFP-Unet: A novel deep learning based approach for left ventricle segmentation in echocardiography

分割 人工智能 豪斯多夫距离 计算机科学 模式识别(心理学) 射血分数 编码器 特征(语言学) 心室 计算机视觉 数学 统计 医学 心脏病学 哲学 语言学 心力衰竭
作者
Shakiba Moradi,Mostafa Ghelich Oghli,Azin Alizadehasl,Isaac Shiri,Niki Oveisi,Mehrdad Oveisi,Majid Maleki,Jan D’hooge
出处
期刊:Physica Medica [Elsevier]
卷期号:67: 58-69 被引量:116
标识
DOI:10.1016/j.ejmp.2019.10.001
摘要

Segmentation of the Left ventricle (LV) is a crucial step for quantitative measurements such as area, volume, and ejection fraction. However, the automatic LV segmentation in 2D echocardiographic images is a challenging task due to ill-defined borders, and operator dependence issues (insufficient reproducibility). U-net, which is a well-known architecture in medical image segmentation, addressed this problem through an encoder-decoder path. Despite outstanding overall performance, U-net ignores the contribution of all semantic strengths in the segmentation procedure. In the present study, we have proposed a novel architecture to tackle this drawback. Feature maps in all levels of the decoder path of U-net are concatenated, their depths are equalized, and up-sampled to a fixed dimension. This stack of feature maps would be the input of the semantic segmentation layer. The performance of the proposed model was evaluated using two sets of echocardiographic images: one public dataset and one prepared dataset. The proposed network yielded significantly improved results when comparing with results from U-net, dilated U-net, Unet++, ACNN, SHG, and deeplabv3. An average Dice Metric (DM) of 0.953, Hausdorff Distance (HD) of 3.49, and Mean Absolute Distance (MAD) of 1.12 are achieved in the public dataset. The correlation graph, bland-altman analysis, and box plot showed a great agreement between automatic and manually calculated volume, area, and length.
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