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Induced volatolomics of pathologies

代谢物 计算生物学 代谢组学 生化工程 代谢活性 医学 内生 人类疾病 生物 计算机科学 疾病 生物信息学 生物系统 病理 生物化学 工程类
作者
Fabiola Djago,Justin Lange,Pauline Poinot
出处
期刊:Nature Reviews Chemistry [Springer Nature]
卷期号:5 (3): 183-196 被引量:21
标识
DOI:10.1038/s41570-020-00248-z
摘要

Volatolomics allows us to elucidate cell metabolic processes in real time. In particular, a volatile organic compound (VOC) excreted from our bodies may be specific for a certain disease, such that measuring this VOC may afford a simple, fast, accessible and safe diagnostic approach. Yet, finding the optimal endogenous volatile marker specific to a pathology is non-trivial because of interlaboratory disparities in sample preparation and analysis, as well as high interindividual variability. These limit the sensitivity and specificity of volatolomics and its applications in biological and clinical fields but have motivated the development of induced volatolomics. This approach aims to overcome issues by measuring VOCs that result not from an endogenous metabolite but, rather, from the pathogen-specific or metabolic-specific enzymatic metabolism of an exogenous biological or chemical probe. In this Review, we introduce volatile-compound-based probes and discuss how they can be exploited to detect and discriminate pathogenic infections, to assess organ function and to diagnose and monitor cancers in real time. We focus on cases in which labelled probes have informed us about metabolic processes and consider the potential and drawbacks of the probes for clinical trials. Beyond diagnostics, VOC-based probes may also be effective tools to explore biological processes more generally. Biological processes can be monitored in real time using induced volatolomics, whereby metabolism of an exogenous probe affords volatiles diagnostic of healthy functioning or pathogens.
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