Coupling Sensitive Nucleic Acid Amplification with Commercial Pregnancy Test Strips

环介导等温扩增 核酸 生物 埃博拉病毒 滚动圆复制 DNA 计算生物学 分子生物学 生物化学 遗传学 聚合酶 病毒
作者
Yan Du,Arti Pothukuchy,Jimmy Gollihar,Armin Nourani,Bingling Li,Andrew D. Ellington
出处
期刊:Angewandte Chemie [Wiley]
卷期号:56 (4): 992-996 被引量:147
标识
DOI:10.1002/anie.201609108
摘要

Abstract The detection of nucleic acid biomarkers for point‐of‐care (POC) diagnostics is currently limited by technical complexity, cost, and time constraints. To overcome these shortcomings, we have combined loop‐mediated isothermal amplification (LAMP), programmable toehold‐mediated strand‐exchange signal transduction, and standard pregnancy test strips. The incorporation of an engineered hCG–SNAP fusion reporter protein (human chorionic gonadotropin‐O 6 ‐alkylguanine‐DNA alkyltransferase) led to LAMP‐to‐hCG signal transduction on low‐cost, commercially available pregnancy test strips. Our assay reliably detected as few as 20 copies of Ebola virus templates in both human serum and saliva and could be adapted to distinguish a common melanoma‐associated SNP allele (BRAF V600E) from the wild‐type sequence. The methods described are completely generalizable to many nucleic acid biomarkers, and could be adapted to provide POC diagnostics for a range of pathogens.
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