Establishment of a porcine parvovirus (PPV) DNA standard and evaluation of a new LightCycler nested-PCR assay for detection of PPV

生物 猪细小病毒 病毒学 分子生物学 细小病毒 套式聚合酶链反应 细小病毒科 聚合酶链反应 基因组 实时聚合酶链反应 质粒 DNA 病毒 遗传学 基因
作者
Grigori G. Prikhod’ko,Herbert Reyes,I. А. Vasilyeva,Thomas F. Busby
出处
期刊:Journal of Virological Methods [Elsevier]
卷期号:111 (1): 13-19 被引量:11
标识
DOI:10.1016/s0166-0934(03)00130-7
摘要

Porcine parvovirus (PPV) is a major causative agent in a syndrome of reproductive failure in swine. In validation (viral clearance) studies, PPV is a model of non-enveloped viruses and is widely used instead of human parvovirus B19, which causes a variety of illnesses including erythema infectiosum (fifth disease) in children and hydrops fetalis in pregnant women. To improve the sensitivity of current PCR-based assays for detection of PPV and to standardize the quantification of PPV, we have developed a lightcycler (LC) nested-PCR (nPCR) assay and constructed a PPV DNA standard evaluated in the LC nPCR assay. The PPV DNA standard, a plasmid termed pPPV, encodes a 3.3 kb PPV NADL-2 genome fragment. One genome copy equivalent (gce) of PPV equals 6.7 attograms of pPPV. The LC nPCR assay is a simple and specific method developed for detection of PPV strains but not any other viruses including members of Parvoviridae. The first 25-cycle PCR with outer primers chose by comparative analysis of 12 primers in 21 different combinations and a second 45-cycle PCR with inner primers amplify 286 and 251 bp fragments of PPV genome, respectively, for 40 min with a sensitivity of approximately 100 gce per assay (ml). By using the LC nPCR assay for analysis of PPV samples with known infectivity, we found that one 50% tissue culture infectious dose (TCID(50)) equals 1.93 +/- 0.24 log(10) gce.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
一见完成签到,获得积分10
刚刚
chiq发布了新的文献求助10
1秒前
Nanno发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
2秒前
丘比特应助跳跃的白云采纳,获得10
3秒前
qfc发布了新的文献求助10
3秒前
new完成签到,获得积分10
3秒前
green发布了新的文献求助10
4秒前
Xu关闭了Xu文献求助
5秒前
5秒前
w0发布了新的文献求助10
6秒前
spc68应助任性慕青采纳,获得10
6秒前
6秒前
创不可贴发布了新的文献求助10
7秒前
大幻想家关注了科研通微信公众号
8秒前
lll发布了新的文献求助10
8秒前
彤童发布了新的文献求助10
8秒前
8秒前
9秒前
稳重迎曼发布了新的文献求助10
9秒前
Ava应助Brave采纳,获得10
9秒前
wanci应助啦啦啦采纳,获得10
10秒前
11秒前
11秒前
12秒前
bkagyin应助sherlock采纳,获得10
12秒前
12秒前
wuli林完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
称心如意发布了新的文献求助10
13秒前
优卡斯签约钓手完成签到,获得积分10
13秒前
canvas完成签到,获得积分10
14秒前
chenhua5460发布了新的文献求助10
15秒前
养恩完成签到,获得积分10
15秒前
Olivia发布了新的文献求助10
15秒前
Antlia完成签到 ,获得积分10
15秒前
hehao完成签到,获得积分10
16秒前
亚婷儿发布了新的文献求助10
16秒前
高分求助中
Clinical Microbiology Procedures Handbook, Multi-Volume, 5th Edition 临床微生物学程序手册,多卷,第5版 2000
List of 1,091 Public Pension Profiles by Region 1621
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] | NHBS Field Guides & Natural History 1500
The Victim–Offender Overlap During the Global Pandemic: A Comparative Study Across Western and Non-Western Countries 1000
Lloyd's Register of Shipping's Approach to the Control of Incidents of Brittle Fracture in Ship Structures 1000
Brittle fracture in welded ships 1000
King Tyrant 680
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 计算机科学 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 复合材料 内科学 化学工程 人工智能 催化作用 遗传学 数学 基因 量子力学 物理化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5583981
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4667534
关于积分的说明 14768286
捐赠科研通 4609869
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2529501
邀请新用户注册赠送积分活动 1498583
关于科研通互助平台的介绍 1467223