Establishment of a porcine parvovirus (PPV) DNA standard and evaluation of a new LightCycler nested-PCR assay for detection of PPV

生物 猪细小病毒 病毒学 分子生物学 细小病毒 套式聚合酶链反应 细小病毒科 聚合酶链反应 基因组 实时聚合酶链反应 质粒 DNA 病毒 遗传学 基因
作者
Grigori G. Prikhod’ko,Herbert Reyes,I. А. Vasilyeva,Thomas F. Busby
出处
期刊:Journal of Virological Methods [Elsevier]
卷期号:111 (1): 13-19 被引量:11
标识
DOI:10.1016/s0166-0934(03)00130-7
摘要

Porcine parvovirus (PPV) is a major causative agent in a syndrome of reproductive failure in swine. In validation (viral clearance) studies, PPV is a model of non-enveloped viruses and is widely used instead of human parvovirus B19, which causes a variety of illnesses including erythema infectiosum (fifth disease) in children and hydrops fetalis in pregnant women. To improve the sensitivity of current PCR-based assays for detection of PPV and to standardize the quantification of PPV, we have developed a lightcycler (LC) nested-PCR (nPCR) assay and constructed a PPV DNA standard evaluated in the LC nPCR assay. The PPV DNA standard, a plasmid termed pPPV, encodes a 3.3 kb PPV NADL-2 genome fragment. One genome copy equivalent (gce) of PPV equals 6.7 attograms of pPPV. The LC nPCR assay is a simple and specific method developed for detection of PPV strains but not any other viruses including members of Parvoviridae. The first 25-cycle PCR with outer primers chose by comparative analysis of 12 primers in 21 different combinations and a second 45-cycle PCR with inner primers amplify 286 and 251 bp fragments of PPV genome, respectively, for 40 min with a sensitivity of approximately 100 gce per assay (ml). By using the LC nPCR assay for analysis of PPV samples with known infectivity, we found that one 50% tissue culture infectious dose (TCID(50)) equals 1.93 +/- 0.24 log(10) gce.
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