Application of Correlation Pre-Filtering Neural Network to DNA Methylation Data: Biological Aging Prediction

DNA甲基化 相关性 人工神经网络 解析 计算机科学 人工智能 甲基化 计算生物学 DNA 机器学习 模式识别(心理学) 生物 遗传学 数学 基因 基因表达 几何学
作者
Lechuan Li,Chonghao Zhang,Hannah Guan,Yu Zhang
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 201-210
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-1994-0_15
摘要

We introduce the CPFNN (Correlation Pre-Filtering Neural Network) for biological age prediction based on blood DNA methylation data. The model is built on 20,000 top correlated DNA methylation features and trained by 1810 healthy samples from GEO database. The input data format and the instructions for parser and CPFNN model are detailed in this chapter. Followed by two potential uses, age acceleration detection and unknown age prediction are discussed.
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