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A pH‐Cascaded DNA Hydrogel Mediated by Reconfigurable A‐motif Duplex, i‐Motif Quadruplex, and T·A‐T Triplex Structures

质子化 自愈水凝胶 胸腺嘧啶 脱质子化 DNA 胞嘧啶 复式(建筑) 碱基 立体化学 化学 主题(音乐) 结晶学 生物物理学 生物化学 高分子化学 有机化学 生物 离子 物理 声学
作者
Yuwei Hu,Yujie Ke,Itamar Willner
出处
期刊:Advanced Functional Materials [Wiley]
卷期号:33 (45)
标识
DOI:10.1002/adfm.202304966
摘要

Abstract Governed by pH‐configurable A‐motif, i‐motif and T·A‐T triplex configurations, a cascaded DNA hydrogel subjecting to diverse pH values is presented. Under highly acidic conditions (pH 1.1), N1 protonation of adenine (p K a 3.5) in A‐strands generates AH + ‐H + A units, resulting in a parallel A‐motif duplex crosslinked hydrogel. Under mild acid conditions (pH 5.2), the dissociation of A‐motif duplex into single A‐strands occurs due to the deprotonation of adenine, while N3 protonation of cytosine (p K a 6.5) in C‐strands creates hemi‐protonated C:C + units, resulting in i‐motif bridged hydrogel. At neutral pH (pH 7.2), deprotonation of cytosine separates i‐motif crosslinkers. Simultaneously, the addition of auxiliary T‐strands results in the N3 protonation of thymine (p K a 10), generating T·A‐T triplex stabilized hydrogel. Under mildly alkaline conditions (pH 10.2), T·A‐T triplex separates into single T‐stands and A‐T duplex, resulting in the disassembly of DNA hydrogel. Therefore, a stepwise pH‐cascaded DNA hydrogel dictates the formation of structures following the pH steps 1.1 → 5.2 → 7.2 → 10.2 where pH‐triggered DNA secondary structures, including A‐motif, i‐motif and T·A‐T triplex, stabilize the hydrogel. The study advances DNA hydrogels from single pH‐responsiveness to multiple cascaded pH values, which opens up new possibilities for the development of smart hydrogels capable of adapting to various environmental conditions.
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