Lipid metabolism-related genes are involved in the occurrence of asthma and regulate the immune microenvironment

生物 免疫系统 转录组 基因 脂质代谢 CD8型 免疫学 RNA干扰 基因表达 遗传学 核糖核酸 内分泌学
作者
Yuanmin Jia,Haixia Wang,Bin Ma,Zeyi Zhang,Jingjing Wang,Jin Wang,Ou Chen
出处
期刊:BMC Genomics [BioMed Central]
卷期号:25 (1) 被引量:2
标识
DOI:10.1186/s12864-023-09795-3
摘要

Lipid metabolism plays a pivotal role in asthma pathogenesis. However, a comprehensive analysis of the importance of lipid metabolism-related genes (LMRGs) in regulating the immune microenvironment in asthma remains lacking. The transcriptome matrix was downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) dataset. Differentially expressed analysis and weighted gene coexpression network analysis (WGCNA) were conducted on the GSE74986 dataset to select hub LMRGs, and gene set enrichment analysis (GSEA) was conducted to explore their biological functions. The CIBERSORT algorithm was used to determine immune infiltration in the asthma and control groups, and the correlation of diagnostic biomarkers and immune cells was performed via Spearman correlation analysis. Subsequently, a competitive endogenous RNA (ceRNA) network was constructed to investigate the hidden molecular mechanism of asthma. The expression levels of the hub genes were further validated in the GSE143192 dataset, and RT‒qPCR and immunofluorescence were performed to verify the reliability of the results in the OVA asthma model. Lastly, the ceRNA network was confirmed by qRT-PCR and RNAi experiments in the characteristic cytokine (IL-13)-induced asthma cellular model.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
科研通AI6.2的应助被小趴菜采纳,获得10
2秒前
香蕉觅云的应助被小趴菜采纳,获得10
2秒前
5秒前
kyt_vip完成签到,获得积分10
5秒前
xx完成签到 ,获得积分10
7秒前
8秒前
清新的问梅完成签到 ,获得积分10
8秒前
乔杰完成签到 ,获得积分10
10秒前
橙子橙完成签到,获得积分10
10秒前
16秒前
小趴菜发布了新的文献求助10
17秒前
煲汤的螃蟹完成签到 ,获得积分10
19秒前
XU博士完成签到,获得积分10
19秒前
20秒前
arniu2008发布了新的文献求助10
21秒前
lili完成签到 ,获得积分10
21秒前
温温发布了新的文献求助10
25秒前
勤恳含之完成签到 ,获得积分10
26秒前
葱饼完成签到 ,获得积分10
27秒前
28秒前
32秒前
靓丽的平蝶完成签到 ,获得积分10
34秒前
34秒前
踏实海豚完成签到 ,获得积分10
37秒前
小趴菜发布了新的文献求助10
39秒前
爱听歌未来完成签到,获得积分10
40秒前
Xixi完成签到 ,获得积分10
42秒前
雪山大地发布了新的文献求助10
43秒前
石头完成签到,获得积分10
43秒前
害怕的元霜完成签到,获得积分10
45秒前
研友_GZ3zRn完成签到 ,获得积分0
46秒前
小趴菜发布了新的文献求助10
46秒前
朴实航空完成签到 ,获得积分10
50秒前
积极问凝完成签到 ,获得积分10
52秒前
科研通AI6.4的应助被小趴菜采纳,获得10
55秒前
Tonald Yang发布了新的文献求助10
55秒前
55秒前
青平完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
忧郁血茗完成签到,获得积分10
1分钟前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Spec 401: Standards for Jet Fuel Facility and Equipment Commissioning and Flushing at Airports, 2026.1 (Original Issue) 1000
Spec 103: Standard for Jet Fuel Quality Control at Airports, Revision 2026.1 1000
Klimaschutzrecht durch den Energiesektor im Mehrebenensystem – Ein Rechtsvergleich 1000
Topological Photonics: Fundamentals and Applications 500
5th World Conference on Detergents: Reinventing the Industry : Opportunities and Challenges 500
Les Mots du discours 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 计算机科学 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 物理 复合材料 内科学 催化作用 光电子学 人工智能 细胞生物学 无机化学 物理化学 数学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 8097576
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9508110
关于积分的说明 21463898
捐赠科研通 7672177
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3407219
关于科研通互助平台的介绍 2535231
邀请新用户注册赠送积分活动 2446709