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LAP-MALDI MS Profiling and Identification of Potential Biomarkers for the Detection of Bovine Tuberculosis

线性判别分析 肺结核 色谱法 结核菌素 牛结核病 医学 结核分枝杆菌 牛分枝杆菌 病理 化学 人工智能 计算机科学
作者
Sophie E. Lellman,C.K. Reynolds,A. K. Jones,Nick Taylor,Rainer Cramer
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:71 (37): 13899-13905 被引量:2
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.3c01879
摘要

Detecting bovine tuberculosis (bTB) primarily relies on the tuberculin skin test, requiring two separate animal handling events with a period of incubation time (normally 3 days) between them. Here, we present the use of liquid atmospheric pressure (LAP)-MALDI for the identification of bTB infection, employing a three-class prediction model that was obtained by supervised linear discriminant analysis (LDA) and tested with bovine mastitis samples as disease-positive controls. Noninvasive collection of nasal swabs was used to collect samples, which were subsequently subjected to a short (<4 h) sample preparation method. Cross-validation of the three-class LDA model from the processed nasal swabs provided a sensitivity of 75.0% and specificity of 90.1%, with an overall classification accuracy of 85.7%. These values are comparable to those for the skin test, showing that LAP-MALDI MS has the potential to provide an alternative single-visit diagnostic platform that can detect bTB within the same day of sampling.
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