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tRNA-derived RNA fragment, tRF-18-8R6546D2, promotes pancreatic adenocarcinoma progression by directly targeting ASCL2

生物 核糖核酸 腺癌 转移RNA 片段(逻辑) 分子生物学 RNA结合蛋白 癌症研究 遗传学 计算生物学 生物信息学 基因 癌症 算法 计算机科学
作者
Sihua Lan,S L Liu,Ke Wang,Wenying Chen,Ke Wang,S L Liu,S L Liu
出处
期刊:Gene [Elsevier]
卷期号:927: 148739-148739
标识
DOI:10.1016/j.gene.2024.148739
摘要

Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) is a life-threatening cancer. Exploring new diagnosis and treatment targets helps improve its prognosis. tRNA-derived small non-coding RNAs (tsRNAs) are a novel type of gene expression regulators and their dysregulation is closely related to many human cancers. Yet the expression and functions of tsRNAs in PAAD are not well understood. Our study used RNA sequencing to identify tsRNA expression profiles in PAAD cells cultured in no or high glucose media and found tRF-18-8R6546D2 was an uncharacterized tsRNA, which has significantly high expression in PAAD cells and tissues. Clinically, tRF-18-8R6546D2 is linked to poor prognosis in PAAD patients and can be used to distinguish them from healthy populations. Functionally, in vitro and vivo, tRF-18-8R6546D2 over-expression promoted PAAD cell proliferation, migration and invasion, inhibited apoptosis, whereas tRF-18-8R6546D2 knock-down showed opposite effects. Mechanistically, tRF-18-8R6546D2 promoted PAAD malignancy partly by directly silencing ASCL2 and further regulating its downstream genes such as MYC and CASP3. These findings show that tRF-18-8R6546D2 is a novel oncogenic factor and can be a promising diagnostic or prognostic biomarker and therapeutic target for PAAD.
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