Antarctic ice core samples: culturable bacterial diversity

生物 放线菌门 厚壁菌 系统类型 拟杆菌 蛋白质细菌 16S核糖体RNA 植物 细菌 微生物学 生态学 动物 遗传学
作者
Sisinthy Shivaji,Zareena Begum,Singireesu Soma Shiva Nageswara Rao,Puram V. Vishnu Vardhan Reddy,Poorna Manasa,Buddi Sailaja,Mambatta S. Prathiba,Meloth Thamban,K. P. Krishnan,Shiv Govind Singh,T. N. R. Srinivas
出处
期刊:Research in Microbiology [Elsevier]
卷期号:164 (1): 70-82 被引量:29
标识
DOI:10.1016/j.resmic.2012.09.001
摘要

Culturable bacterial abundance at 11 different depths of a 50.26 m ice core from the Tallaksenvarden Nunatak, Antarctica, varied from 0.02 to 5.8 × 10(3) CFU ml(-1) of the melt water. A total of 138 bacterial strains were recovered from the 11 different depths of the ice core. Based on 16S rRNA gene sequence analyses, the 138 isolates could be categorized into 25 phylotypes belonging to phyla Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes and Proteobacteria. All isolates had 16S rRNA sequences similar to previously determined sequences (97.2-100%). No correlation was observed in the distribution of the isolates at the various depths either at the phylum, genus or species level. The 25 phylotypes varied in growth temperature range, tolerance to NaCl, growth pH range and ability to produce eight different extracellular enzymes at either 4 or 18 °C. Iso-, anteiso-, unsaturated and saturated fatty acids together constituted a significant proportion of the total fatty acid composition.
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