HSM6AP: a high-precision predictor for the Homo sapiens N6-methyladenosine (m^6 A) based on multiple weights and feature stitching

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作者
Jing Li,He Shida,Fei Guo,Quan Zou
出处
期刊:RNA Biology [Informa]
卷期号:18 (11): 1882-1892 被引量:23
标识
DOI:10.1080/15476286.2021.1875180
摘要

Recent studies have shown that RNA methylation modification can affect RNA transcription, metabolism, splicing and stability. In addition, RNA methylation modification has been associated with cancer, obesity and other diseases. Based on information about human genome and machine learning, this paper discusses the effect of the fusion sequence and gene-level feature extraction on the accuracy of methylation site recognition. The significant limitation of existing computing tools was exposed by discovered of new features. (1) Most prediction models are based solely on sequence features and use SVM or random forest as classification methods. (2) Limited by the number of samples, the model may not achieve good performance. In order to establish a better prediction model for methylation sites, we must set specific weighting strategies for training samples and find more powerful and informative feature matrices to establish a comprehensive model. In this paper, we present HSM6AP, a high-precision predictor for the
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