Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean

基因组 北极的 生物地球化学循环 生态学 生物 古细菌 微生物生态学 海洋学 基因组 细菌 基因 遗传学 地质学
作者
Marta Royo‐Llonch,Pablo Sánchez,Clara Ruiz‐González,Guillem Salazar,Carlos Pedrós‐Alió,Marta Sebastián,Karine Labadie,Lucas Paoli,Federico M. Ibarbalz,Lucie Zinger,Benjamin Churcheward,Marcel Babin,Peer Bork,Emmanuel Boss,Guy Cochrane,Colomban de Vargas,Gabriel Gorsky,Nigel Grimsley,Lionel Guidi,Pascal Hingamp
出处
期刊:Nature microbiology [Nature Portfolio]
卷期号:6 (12): 1561-1574 被引量:89
标识
DOI:10.1038/s41564-021-00979-9
摘要

The role of the Arctic Ocean ecosystem in climate regulation may depend on the responses of marine microorganisms to environmental change. We applied genome-resolved metagenomics to 41 Arctic seawater samples, collected at various depths in different seasons during the Tara Oceans Polar Circle expedition, to evaluate the ecology, metabolic potential and activity of resident bacteria and archaea. We assembled 530 metagenome-assembled genomes (MAGs) to form the Arctic MAGs catalogue comprising 526 species. A total of 441 MAGs belonged to species that have not previously been reported and 299 genomes showed an exclusively polar distribution. Most Arctic MAGs have large genomes and the potential for fast generation times, both of which may enable adaptation to a copiotrophic lifestyle in nutrient-rich waters. We identified 38 habitat generalists and 111 specialists in the Arctic Ocean. We also found a general prevalence of 14 mixotrophs, while chemolithoautotrophs were mostly present in the mesopelagic layer during spring and autumn. We revealed 62 MAGs classified as key Arctic species, found only in the Arctic Ocean, showing the highest gene expression values and predicted to have habitat-specific traits. The Artic MAGs catalogue will inform our understanding of polar microorganisms that drive global biogeochemical cycles.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
tan_sg发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
orchid完成签到,获得积分10
2秒前
9tt发布了新的文献求助200
2秒前
情怀应助llzuo采纳,获得10
2秒前
小航爱学习完成签到,获得积分20
3秒前
zxcv发布了新的文献求助30
3秒前
面包牛奶会有的完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
快乐水完成签到,获得积分10
3秒前
海带完成签到,获得积分10
4秒前
Knight完成签到,获得积分10
4秒前
5秒前
明明完成签到,获得积分20
6秒前
马婷婷完成签到,获得积分10
6秒前
长情孤风发布了新的文献求助10
6秒前
荒诞DE谎言完成签到 ,获得积分10
6秒前
6秒前
Felix发布了新的文献求助10
7秒前
听闻墨笙发布了新的文献求助30
7秒前
zy完成签到,获得积分10
7秒前
思源应助王鹏飞采纳,获得10
7秒前
超级涔雨完成签到,获得积分10
8秒前
无花果应助潇洒的问夏采纳,获得10
8秒前
Yatpome完成签到,获得积分10
9秒前
陶远望完成签到,获得积分10
9秒前
汉堡包应助杨佳于采纳,获得30
9秒前
小艾发布了新的文献求助10
9秒前
拾星完成签到,获得积分10
9秒前
rong_w完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
Ahsan完成签到,获得积分10
10秒前
布丁完成签到,获得积分10
10秒前
苻人英完成签到,获得积分10
10秒前
YSHZ发布了新的文献求助10
11秒前
Yu完成签到,获得积分20
11秒前
11秒前
ONION完成签到,获得积分10
11秒前
lmq完成签到 ,获得积分10
11秒前
yyyfff应助牧羊人采纳,获得10
11秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Cognitive Neuroscience: The Biology of the Mind 1000
Technical Brochure TB 814: LPIT applications in HV gas insulated switchgear 1000
Immigrant Incorporation in East Asian Democracies 600
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
A Preliminary Study on Correlation Between Independent Components of Facial Thermal Images and Subjective Assessment of Chronic Stress 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3968771
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3513646
关于积分的说明 11169065
捐赠科研通 3249011
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1794589
邀请新用户注册赠送积分活动 875236
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 804740