Compendium of 530 metagenome-assembled bacterial and archaeal genomes from the polar Arctic Ocean

基因组 北极的 生物地球化学循环 生态学 生物 古细菌 微生物生态学 海洋学 基因组 细菌 基因 遗传学 地质学
作者
Marta Royo‐Llonch,Pablo Sánchez,Clara Ruiz‐González,Guillem Salazar,Carlos Pedrós‐Alió,Marta Sebastián,Karine Labadie,Lucas Paoli,Federico M. Ibarbalz,Lucie Zinger,Benjamin Churcheward,Marcel Babin,Peer Bork,Emmanuel Boss,Guy Cochrane,Colomban de Vargas,Gabriel Gorsky,Nigel Grimsley,Lionel Guidi,Pascal Hingamp
出处
期刊:Nature microbiology [Nature Portfolio]
卷期号:6 (12): 1561-1574 被引量:103
标识
DOI:10.1038/s41564-021-00979-9
摘要

The role of the Arctic Ocean ecosystem in climate regulation may depend on the responses of marine microorganisms to environmental change. We applied genome-resolved metagenomics to 41 Arctic seawater samples, collected at various depths in different seasons during the Tara Oceans Polar Circle expedition, to evaluate the ecology, metabolic potential and activity of resident bacteria and archaea. We assembled 530 metagenome-assembled genomes (MAGs) to form the Arctic MAGs catalogue comprising 526 species. A total of 441 MAGs belonged to species that have not previously been reported and 299 genomes showed an exclusively polar distribution. Most Arctic MAGs have large genomes and the potential for fast generation times, both of which may enable adaptation to a copiotrophic lifestyle in nutrient-rich waters. We identified 38 habitat generalists and 111 specialists in the Arctic Ocean. We also found a general prevalence of 14 mixotrophs, while chemolithoautotrophs were mostly present in the mesopelagic layer during spring and autumn. We revealed 62 MAGs classified as key Arctic species, found only in the Arctic Ocean, showing the highest gene expression values and predicted to have habitat-specific traits. The Artic MAGs catalogue will inform our understanding of polar microorganisms that drive global biogeochemical cycles.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
跳跃的太君完成签到,获得积分10
刚刚
1024完成签到,获得积分10
刚刚
orixero应助Lukomere采纳,获得10
1秒前
Oasis发布了新的文献求助10
1秒前
Jasper应助ceeray23采纳,获得20
1秒前
科研通AI2S应助日落采纳,获得10
1秒前
大方芾发布了新的文献求助10
1秒前
乖拉完成签到,获得积分10
1秒前
michaelvin完成签到,获得积分10
1秒前
哈哈哈完成签到,获得积分10
2秒前
water完成签到,获得积分10
2秒前
梓辰完成签到 ,获得积分10
2秒前
亚亚呀完成签到,获得积分10
2秒前
思源应助zhy采纳,获得10
2秒前
大肥羊发布了新的文献求助10
3秒前
大美女发布了新的文献求助10
3秒前
隐形曼青应助安详晓亦采纳,获得10
3秒前
Mic应助lina采纳,获得10
3秒前
xiaolei001应助yciDo采纳,获得10
4秒前
TonyXWZhang完成签到,获得积分10
4秒前
16发布了新的文献求助10
4秒前
俗人完成签到,获得积分10
4秒前
5秒前
冲冲冲发布了新的文献求助10
5秒前
under完成签到,获得积分10
5秒前
轻松的鑫完成签到,获得积分10
5秒前
zoe完成签到,获得积分10
7秒前
内向的跳跳糖完成签到,获得积分10
8秒前
北风完成签到,获得积分10
8秒前
华仔应助NMR采纳,获得10
8秒前
CatC完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
量子星尘发布了新的文献求助20
9秒前
yciDo完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
10秒前
ll完成签到 ,获得积分10
10秒前
大肥羊完成签到,获得积分10
11秒前
XuNan完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
List of 1,091 Public Pension Profiles by Region 1621
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] | NHBS Field Guides & Natural History 1500
Lloyd's Register of Shipping's Approach to the Control of Incidents of Brittle Fracture in Ship Structures 1000
Brittle fracture in welded ships 1000
Metagames: Games about Games 700
King Tyrant 680
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 计算机科学 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 复合材料 内科学 化学工程 人工智能 催化作用 遗传学 数学 基因 量子力学 物理化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5573758
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4660031
关于积分的说明 14727408
捐赠科研通 4599888
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2524520
邀请新用户注册赠送积分活动 1494877
关于科研通互助平台的介绍 1464977