Rhizobium changzhiense sp. nov., isolated from effective nodules of Vicia sativa L. in North China

生物 系统发育树 16S核糖体RNA 根瘤菌 植物 拉伤 谱系(遗传) 序列分析 基因 遗传学 解剖
作者
Junjie Zhang,Shanshan Peng,Mitchell Andrews,Chunzeng Liu,Yimin Shang,Shuo Li,Entao Wang,Xiaoxia Zhang
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:71 (3) 被引量:16
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.004724
摘要

Three fast-growing rhizobial strains isolated from effective nodules of common vetch ( Vicia sativa L.) were characterized using a polyphasic approach. All three strains were assigned to the genus Rhizobium on the basis of the results of 16S rRNA gene sequence analysis. Phylogenetic analysis based on concatenated atpD-recA genes separated the strains into a distinct lineage represented by WYCCWR 11279 T , which showed average nucleotide identity values of 95.40 and 93.61 % with the most similar phylogenetic type strains of Rhizobium sophorae CCBAU 03386 T and Rhizobium laguerreae FB T T , respectively. The digital DNA–DNA hybridization relatedness values between WYCCWR 11279 T and the closest related type strains were less than 70 %. Therefore, a novel rhizobial species is proposed, Rhizobium changzhiense sp. nov., and strain WYCCWR 11279 T (=HAMBI 3709 T =LMG 31534 T ) is designated as the type strain for the novel species.

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