已入深夜,您辛苦了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!祝你早点完成任务,早点休息,好梦!

Methylation analysis of plasma cell-free DNA for breast cancer early detection using bisulfite next-generation sequencing

DNA甲基化 乳腺癌 亚硫酸氢盐测序 甲基化 亚硫酸氢盐 CpG站点 生物标志物 癌症 肿瘤科 生物 癌症研究 医学 内科学 基因 基因表达 遗传学
作者
Zibo Li,Xinwu Guo,Lili Tang,Limin Peng,Ming Chen,Xipeng Luo,Shouman Wang,Xu Zhi,Zhongping Deng,Linjie Dai,Kun Xia,Jun Wang
出处
期刊:Tumor Biology [SAGE Publishing]
卷期号:37 (10): 13111-13119 被引量:39
标识
DOI:10.1007/s13277-016-5190-z
摘要

Circulating cell-free DNA (cfDNA) has been considered as a potential biomarker for non-invasive cancer detection. To evaluate the methylation levels of six candidate genes (EGFR, GREM1, PDGFRB, PPM1E, SOX17, and WRN) in plasma cfDNA as biomarkers for breast cancer early detection, quantitative analysis of the promoter methylation of these genes from 86 breast cancer patients and 67 healthy controls was performed by using microfluidic-PCR-based target enrichment and next-generation bisulfite sequencing technology. The predictive performance of different logistic models based on methylation status of candidate genes was investigated by means of the area under the ROC curve (AUC) and odds ratio (OR) analysis. Results revealed that EGFR, PPM1E, and 8 gene-specific CpG sites showed significantly hypermethylation in cancer patients’ plasma and significantly associated with breast cancer (OR ranging from 2.51 to 9.88). The AUC values for these biomarkers were ranging from 0.66 to 0.75. Combinations of multiple hypermethylated genes or CpG sites substantially improved the predictive performance for breast cancer detection. Our study demonstrated the feasibility of quantitative measurement of candidate gene methylation in cfDNA by using microfluidic-PCR-based target enrichment and bisulfite next-generation sequencing, which is worthy of further validation and potentially benefits a broad range of applications in clinical oncology practice. Quantitative analysis of methylation pattern of plasma cfDNA by next-generation sequencing might be a valuable non-invasive tool for early detection of breast cancer.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
眼睛大的胡萝卜完成签到 ,获得积分10
刚刚
盐先生完成签到 ,获得积分10
4秒前
太叔丹翠完成签到 ,获得积分10
5秒前
5秒前
7秒前
8秒前
香蕉觅云应助Dz1990m采纳,获得10
8秒前
龙弟弟完成签到 ,获得积分10
9秒前
婷婷完成签到,获得积分10
12秒前
14秒前
光能使者完成签到,获得积分10
16秒前
19秒前
19秒前
清风明月完成签到 ,获得积分10
20秒前
Sophiaye完成签到,获得积分10
21秒前
只想发财发布了新的文献求助10
21秒前
芯之痕发布了新的文献求助10
22秒前
xiuxiuzhang完成签到 ,获得积分10
22秒前
排骨大王完成签到,获得积分10
23秒前
25秒前
LILING发布了新的文献求助10
26秒前
菲菲酱完成签到 ,获得积分10
27秒前
32秒前
jin发布了新的文献求助10
33秒前
隐形曼青应助大恶魔宝拉采纳,获得30
35秒前
WindDreamer完成签到,获得积分10
36秒前
是述不是沭完成签到,获得积分10
37秒前
落落完成签到 ,获得积分0
38秒前
38秒前
风清扬应助现代期待采纳,获得30
39秒前
科研通AI5应助ruter采纳,获得10
39秒前
41秒前
Yu完成签到,获得积分10
42秒前
44秒前
春山完成签到 ,获得积分10
44秒前
林林完成签到,获得积分10
44秒前
45秒前
Rondab应助蓝色天空采纳,获得10
45秒前
Dz1990m发布了新的文献求助10
46秒前
Yu发布了新的文献求助10
47秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3976572
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3520659
关于积分的说明 11204365
捐赠科研通 3257284
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798667
邀请新用户注册赠送积分活动 877835
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806577