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Microarray analysis of lncRNA and mRNA expression profiles in mice with allergic rhinitis

小桶 下调和上调 微阵列 医学 微阵列分析技术 信号转导 信使核糖核酸 趋化因子 细胞生物学 免疫学 基因表达 生物 基因 炎症 转录组 遗传学
作者
Yue Ma,Le Shi,Cheng Zheng
出处
期刊:International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology [Elsevier BV]
卷期号:104: 58-65 被引量:17
标识
DOI:10.1016/j.ijporl.2017.10.046
摘要

We aimed to identify the effect of lncRNAs in CD4+ T cells on Allergic rhinitis (AR). The present study conducted a microarray to identify the expression profiles of lncRNA and mRNA in CD4+ T cells in both AR murine models and normal controls. And qRT-PCR was used to confirm the results. GO and KEGG enrichment analysis were used to show all related pathways and a co-expression network was conducted to find lncRNAs which have high correlation with these pathways. The results showed that the two groups contained a total of 158 deregulated lncRNAs, of which 110 were upregulated and 48 were downregulated. And positive regulation of calcium ion transport, B cell activation, chemokine-signaling pathways and calcium-signaling pathways may be involved in the development of T cells in AR pathology. Finally, we can find the differentially expressed mRNA in the pathways related to T cell differentiation correlated with many deregulated lncRNAs. The present study was the first to show the differential expression profiles of lncRNAs in the CD4+ T cells of an AR murine model, which may provide significant insights into AR pathogenesis and offer new treatment targets to alleviate it.

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