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Target identification using drug affinity responsive target stability (DARTS)

药品 小分子 计算生物学 药物发现 药物开发 药物靶点 靶蛋白 鉴定(生物学) 天然产物 药物作用 作用机理 化学 生物 药理学 生物化学 体外 基因 植物
作者
Brett Lomenick,Rui Hao,Nao Jonai,R Chin,Mariam Aghajan,Sarah Warburton,Jianing Wang,Raymond Wu,Fernando Gómez,Joseph A. Loo,James A. Wohlschlegel,Thomas M. Vondriska,Jerry Pelletier,Harvey R. Herschman,Jon Clardy,Catherine F. Clarke,Jing Huang
出处
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proceedings of the National Academy of Sciences]
卷期号:106 (51): 21984-21989 被引量:856
标识
DOI:10.1073/pnas.0910040106
摘要

Identifying the molecular targets for the beneficial or detrimental effects of small-molecule drugs is an important and currently unmet challenge. We have developed a method, drug affinity responsive target stability (DARTS), which takes advantage of a reduction in the protease susceptibility of the target protein upon drug binding. DARTS is universally applicable because it requires no modification of the drug and is independent of the mechanism of drug action. We demonstrate use of DARTS to identify known small-molecule-protein interactions and to reveal the eukaryotic translation initiation machinery as a molecular target for the longevity-enhancing plant natural product resveratrol. We envisage that DARTS will also be useful in global mapping of protein-metabolite interaction networks and in label-free screening of unlimited varieties of compounds for development as molecular imaging agents.
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