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The Translational Landscape of the Human Heart

生物 翻译(生物学) 平动调节 计算生物学 翻译效率 基因 真核翻译 基因表达 基因表达调控 信使核糖核酸 遗传学 细胞生物学
作者
Sebastiaan van Heesch,Franziska Witte,Valentin Schneider-Lunitz,Jana Felicitas Schulz,Eleonora Adami,Allison B. Sarkis,Marieluise Kirchner,Henrike Maatz,Susanne Blachut,Clara-Louisa Sandmann,Masatoshi Kanda,Catherine L. Worth,Sebastian Schäfer,Lorenzo Calviello,Rhys Merriott,Giannino Patone,Oliver Hummel,Emanuel Wyler,Benedikt Obermayer,Michael Benedikt Mücke,Eric L. Lindberg,Franziska Trnka,Sebastian Memczak,Marcel Schilling,Leanne E. Felkin,Paul J.R. Barton,Nicholas M. Quaife,Konstantinos Vanezis,Sebastian Diecke,Masaya Mukai,Nancy Mah,Su-Jun Oh,Armin Kurtz,Christoph Schramm,Dorothee Schwinge,Marcial Sebode,Magdaléna Harakaľová,Folkert W. Asselbergs,Aryan Vink,Roel A. de Weger,Sivakumar Viswanathan,Anissa A. Widjaja,Anna Gärtner-Rommel,Hendrik Milting,Cristobal G. dos Remedios,Christoph Knosalla,Philipp Mertins,Markus Landthaler,Martin Vingron,Wolfgang A. Linke,Jonathan G. Seidman,Christine E. Seidman,Nikolaus Rajewsky,Uwe Ohler,Stuart A. Cook,Norbert Hübner
出处
期刊:Cell [Elsevier]
卷期号:178 (1): 242-260.e29 被引量:471
标识
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.010
摘要

Gene expression in human tissue has primarily been studied on the transcriptional level, largely neglecting translational regulation. Here, we analyze the translatomes of 80 human hearts to identify new translation events and quantify the effect of translational regulation. We show extensive translational control of cardiac gene expression, which is orchestrated in a process-specific manner. Translation downstream of predicted disease-causing protein-truncating variants appears to be frequent, suggesting inefficient translation termination. We identify hundreds of previously undetected microproteins, expressed from lncRNAs and circRNAs, for which we validate the protein products in vivo. The translation of microproteins is not restricted to the heart and prominent in the translatomes of human kidney and liver. We associate these microproteins with diverse cellular processes and compartments and find that many locate to the mitochondria. Importantly, dozens of microproteins are translated from lncRNAs with well-characterized noncoding functions, indicating previously unrecognized biology.
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