Genome-wide screening identifies Trim33 as an essential regulator of dendritic cell differentiation

调节器 生物 细胞生物学 基因组 细胞分化 利基 计算生物学 基因 遗传学 生态学
作者
Ioanna Tiniakou,Pei-Feng Hsu,Lorena S. Lopez-Zepeda,Görkem Garipler,Eduardo Esteva,Nicholas M. Adams,Geunhyo Jang,Chetna Soni,Colleen M. Lau,Fan Liu,Alireza Khodadadi‐Jamayran,Tori Rodrick,Drew R. Jones,Aristotelis Tsirigos,Uwe Ohler,Mark T. Bedford,Stephen D. Nimer,Vesa Kaartinen,Esteban O. Mazzoni,Boris Reizis
出处
期刊:Science immunology [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:9 (94) 被引量:2
标识
DOI:10.1126/sciimmunol.adi1023
摘要

The development of dendritic cells (DCs), including antigen-presenting conventional DCs (cDCs) and cytokine-producing plasmacytoid DCs (pDCs), is controlled by the growth factor Flt3 ligand (Flt3L) and its receptor Flt3. We genetically dissected Flt3L-driven DC differentiation using CRISPR-Cas9-based screening. Genome-wide screening identified multiple regulators of DC differentiation including subunits of TSC and GATOR1 complexes, which restricted progenitor growth but enabled DC differentiation by inhibiting mTOR signaling. An orthogonal screen identified the transcriptional repressor Trim33 (TIF-1γ) as a regulator of DC differentiation. Conditional targeting in vivo revealed an essential role of Trim33 in the development of all DCs, but not of monocytes or granulocytes. In particular, deletion of Trim33 caused rapid loss of DC progenitors, pDCs, and the cross-presenting cDC1 subset. Trim33-deficient Flt3
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