Marinicella meishanensis sp. nov., a novel Marinicella member isolated from coastal mudflat sediment of Meishan Islandin the East China Sea

生物 16S核糖体RNA 拉伤 系统发育树 磷脂酰甘油 微生物学 植物 磷脂酰胆碱 基因 遗传学 磷脂 解剖
作者
Xinyu Liu,Yaqin Chen,Yifan Guo,Shan He,Weiyan Zhang,Lijian Ding
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (5)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006374
摘要

A Gram-negative, rod-shaped, non-motile and strictly aerobic strain, designated NBU2979 T , was isolated from a coastal mudflat located on Meishan Island in the East China Sea. Strain NBU2979 T grew optimally at 32 °C, with 2.0 % NaCl (w/v) and at pH 7.0–7.5. The predominant fatty acid (>10 %) was iso-C 15 : 0 . The major polar lipids included phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, diphosphatidylglycerol, phosphatidyldimethylethanolamine, phosphatidylcholine, an unidentified glycolipid, two unidentified aminophospholipids, an unidentified phospholipid and an unidentified lipid. The only respiratory quinone was ubiquinone-8. Comparative analysis of 16S rRNA gene sequences showed that strain NBU2979 T exhibited highest similarity to Marinicella sediminis F2 T (98.0 %), Marinicella marina S1101 T (97.5 %), Marinicella litoralis KMM 3900 T (96.6 %), Marinicella rhabdoformis 3539 T (95.5 %), Marinicella pacifica sw153 T (95.2 %) and Marinicella gelatinilytica S6413 T (94.9 %). Phylogenetic analyses indicated that strain NBU2979 T clustered with the genus Marinicella and was closely related to strain M. sediminis F2 T . The average nucleotide identity and digital DNA–DNA hybridization values between strain NBU2979 T and related species of genus Marinicella were well below the threshold limit for prokaryotic species delineation. The DNA G+C content of strain NBU2979 T was 51.6 mol%. Based on its phenotypic, chemotaxonomic and genotypic data, strain NBU2979 T (=KCTC 82911 T =MCCC 1K06402 T ) is considered to be a representative of a novel species in the genus Marinicella , for which the name Marinicella meishanensis sp. nov. is proposed.
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