Mapping Protein-Protein Proximity in the Purinosome

化学 计算生物学 生物
作者
Yijun Deng,Jongsik Gam,Jarrod B. French,Hong Zhao,Songon An,Stephen J. Benkovic
出处
期刊:Journal of Biological Chemistry [Elsevier]
卷期号:287 (43): 36201-36207 被引量:64
标识
DOI:10.1074/jbc.m112.407056
摘要

The enzymes in the human de novo purine synthesis pathway were found to form a cellular complex, the purinosome, upon culturing cells in purine-depleted medium (An, S., Kumar R., Sheets, E. D., and Benkovic, S. J. (2008) Science 320, 103–106). Purinosome formation and dissociation were found to be modulated by several factors, including the microtubule network and cell signaling involving protein phosphorylation. To determine whether the pathway enzymes are in physical contact, we probed for the protein-protein interactions (PPIs) within the purinosome with a novel application of the Tango PPI reporter system (Barnea, G., Strapps, W., Herrada, G., Berman, Y., Ong, J., Kloss, B., Axel, R., and Lee, K. J. (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105, 64–69). We found PPIs among all six enzymes within the pathway and evidence for a core involving the first three enzymes. We also captured purinosomes under both purine-rich and purine-depleted conditions. The results provide additional insights into the transient nature and topography of the purinosome.
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