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Tepidibacillus marianensis sp. nov., a novel heterotrophic iron-reducing bacterium isolated from Mariana Trench sediment

生物 16S核糖体RNA 拉伤 基因组大小 系统发育树 细菌 微生物学 基因 基因组 遗传学 解剖
作者
Shuyi Li,Chenxi Li,Jiahao Pei,Rulong Liu,Jiasong Fang,Yuli Wei,Yu He,Shuzhen Li,Qi Feng,Chenxi Zhang,Tianci Guo,Yongguang Jiang,Yidan Hu,Zhou Jiang,Liang Shi,Yiran Dong
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (6)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006438
摘要

A novel chemoheterotrophic iron-reducing micro-organism, designated as strain LSZ-M11000 T , was isolated from sediment of the Marianas Trench. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene revealed that strain LSZ-M11000 T belonged to genus Tepidibacillus , with 97 % identity to that of Tepidibacillus fermentans STGH T , a mesophilic bacterium isolated from the Severo-Stavropolskoye underground gas storage facility in Russia. The polar lipid profile of strain LSZ-M11000 T consisted of diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, as well as other unidentified phospholipids and lipids. The major fatty acids were C 16 : 0 (28.4 %), C 18 : 0 (15.8 %), iso-C 15 : 0 (12.9 %), and anteiso-C 15 : 0 (12.0 %). Strain LSZ-M11000 T had no menaquinone. Genome sequencing revealed that the genome size of strain LSZ-M11000 T was 2.97 Mb and the DNA G+C content was 37.9 mol%. The average nucleotide identity values between strain LSZ-M11000 T and its close phylogenetic relatives, Tepidibacillus fermentans STGH T and Tepidibacillus decaturensis Z9 T , were 76.4 and 72.6 %, respectively. The corresponding DNA–DNA hybridization estimates were 20.9 and 23.4 %, respectively. Cells of strain LSZ-M11000 T were rod-shaped (1.0–1.5×0.3–0.5 µm). Using pyruvate as an electron donor, it was capable of reducing KMnO 4 , MnO 2 , As(V), NaNO 3 , NaNO 2 , Na 2 SO 4 , Na 2 S 2 O 3 , and K 2 Cr 2 O 7 . Based on phenotypic, genotypic, and phylogenetic evidence, strain LSZ-M11000 T is proposed to be a novel strain of the genus Tepidibacillus , for which the name Tepdibacillus marianensis is proposed. The type strain is LSZ-M11000 T (=CCAM 1008 T =JCM 39431 T ).
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