Pan-tissue methylation aging clock: Recalibrated and a method to analyze and interpret the selected features

表观遗传学 DNA甲基化 甲基化 生物 计算生物学 史诗 生物年龄 衰老 生物信息学 进化生物学 遗传学 DNA 基因表达 基因 文学类 艺术
作者
Karthikeyan Vijayakumar,Gwang-Won Cho
出处
期刊:Mechanisms of Ageing and Development [Elsevier BV]
卷期号:204: 111676-111676 被引量:49
标识
DOI:10.1016/j.mad.2022.111676
摘要

The abundance of the biological data and the rapid evolution of the newer machine learning technologies have increased the epigenetics research in the last decade. This has enhanced the ability to measure the biological age of humans and different organisms via their omics data. DNA methylation array data are commonly used in the prediction of methylation age. Horvath clock has been adopted in various aging studies as a DNA methylation age predicting clock due to its higher accuracy and multi tissue prediction potential. In the current study, we have developed a pan tissue methylation-aging clock by using the publicly available illumina 450k and EPIC array methylation datasets. In doing that, we developed a highly accurate epigenetic clock, which predicts the age of multiple tissues with higher accuracy. We have also analyzed the selected probes for their biological relevance. Upon analyzing the selected features further, we found out evidences, which support the Antagonistic pleiotropy theory of aging.
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