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Development of visual detection of African Swine Fever Virus using CRISPR/LwCas13a lateral flow strip based on structural protein gene D117L

非洲猪瘟病毒 生物 病毒学 重组酶聚合酶扩增 病毒 聚合酶链反应 基因 虫媒病毒 实时聚合酶链反应 遗传学
作者
Desheng Zhang,Sen Jiang,Nengwen Xia,Jiajia Zhang,Anjing Liu,Dafu Deng,Chenyang Zhang,Yuxin Sun,Nanhua Chen,Xiangtao Kang,Zhiming Pan,Wanglong Zheng,Jianzhong Zhu
出处
期刊:Veterinary Microbiology [Elsevier]
卷期号:293: 110073-110073
标识
DOI:10.1016/j.vetmic.2024.110073
摘要

African swine fever virus (ASFV) is a large double stranded DNA arbovirus that is highly contagious and seriously endangers domestic and wild pigs. In the past decade, African swine fever (ASF) has spread in many countries in the Caucasus, Russian Federation, Eastern Europe and Asia, causing significant losses to the pig industry. At present, there is a lack of effective vaccine and treatment for ASF. Therefore, the rapid and accurate detection is crucial for ASF prevention and control. In this study, we have developed a portable lateral flow strip (LFS) detection mediated by recombinase polymerase amplification (RPA) and CRISPR/LwCas13a, which is performed at 37 ℃ and visualized by eyes without the need for complex instruments. This RPA-LwCas13a-LFS is based on the ASFV structural protein p17 gene (D117L), with a detection sensitivity up to 2 gene copies. This method is highly specific and has no cross reactivity to 7 other pig viruses. In the detection of two batches of 100 clinical samples, the p17 (D117L) RPA-LwCas13a-LFS had 100% coincidence with conventional quantitative PCR (qPCR). These findings demonstrate the potential of this simple, rapid, sensitive, and specific ASFV detection method for on-site ASFV detection.
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